Código de barras de la vida y análisis filogenético en las especies de dasylirion del noreste de México
El género Dasylirion comprende un grupo de plantas distribuidas principalmente en zonas áridas del Norte del país, son muy parecidas a los agaves y son utilizadas por los pobladores en la elaboración de cestería (Bogler, 1994), como forraje y de manera muy particular en la elaboración de una bebida alcohólica tradicional llamada “sotol”. Esta bebida es considerada con calidad semejante a la del tequila y el mezcal y actualmente cuenta con protección a la denominación de origen para los estados de Chihuahua, Coahuila y Durango (IMPI, 2001), constituyendo de esta manera un recurso natural con gran potencial de aprovechamiento económico. Existe un alto grado de diversidad incluso entre plantas de la misma especie, el proceso de una correcta identificación botánica con fines de aprovechamiento económico y de investigación se encuentra comprometido, lo cual es motivo para implementar nuevas herramientas que nos faciliten el proceso de identificación y al mismo tiempo generar nuevo acervo genético encaminado a incrementar su inventario taxonómico en zonas áridas y semiáridas. La meta de este trabajo de investigación es caracterizar molecularmente y obtener análisis filogenético de por lo menos 10 especies del género Dasylirion, para lo cual se realizarán colectas de hojas sanas de las diferentes especies de sotol en varias regiones del noreste mexicano, se analizaran muestras de DNA de cinco plantas diferentes de cada especie y los fragmentos de DNA (gen rbcL y gen matK) aislados y amplificados con PCR serán secuenciados y analizados por medio de programas informáticos, algunos de ellos pertenecientes a la Base de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLD), BLAST y FinchTV, cuyo objetivo es alinear y determinar calidad de secuencias respectivamente y otros de acceso libre como ape (Analysis of Phylogenetics and Evolution), phangorn (Phylogenetic Analysis in R) y phyclust (Phylogenetic Clustering), paquetes del lenguaje y ambiente de cómputo R que nos darán información relevante sobre las relaciones filogenéticas dentro y fuera de especie.
| Main Author: | |
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| Other Authors: | |
| Format: | Protocolo de investigación biblioteca |
| Language: | Español |
| Subjects: | Dasylirion, Sotol, Dna, CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA, |
| Online Access: | http://repositorio.uaaan.mx:8080/xmlui/handle/123456789/43238 |
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| Summary: | El género Dasylirion comprende un grupo de plantas distribuidas principalmente en zonas áridas del Norte del país, son muy parecidas a los agaves y son utilizadas por los pobladores en la elaboración de cestería (Bogler, 1994), como forraje y de manera muy particular en la elaboración de una bebida alcohólica tradicional llamada “sotol”. Esta bebida es considerada con calidad semejante a la del tequila y el mezcal y actualmente cuenta con protección a la denominación de origen para los estados de Chihuahua, Coahuila y Durango (IMPI, 2001), constituyendo de esta manera un recurso natural con gran potencial de aprovechamiento económico. Existe un alto grado de diversidad incluso entre plantas de la misma especie, el proceso de una correcta identificación botánica con fines de aprovechamiento económico y de investigación se encuentra comprometido, lo cual es motivo para implementar nuevas herramientas que nos faciliten el proceso de identificación y al mismo tiempo generar nuevo acervo genético encaminado a incrementar su inventario taxonómico en zonas áridas y semiáridas.
La meta de este trabajo de investigación es caracterizar molecularmente y obtener análisis filogenético de por lo menos 10 especies del género Dasylirion, para lo cual se realizarán colectas de hojas sanas de las diferentes especies de sotol en varias regiones del noreste mexicano, se analizaran muestras de DNA de cinco plantas diferentes de cada especie y los fragmentos de DNA (gen rbcL y gen matK) aislados y amplificados con PCR serán secuenciados y analizados por medio de programas informáticos, algunos de ellos pertenecientes a la Base de Datos del Código de Barras de la Vida (BOLD), BLAST y FinchTV, cuyo objetivo es alinear y determinar calidad de secuencias respectivamente y otros de acceso libre como ape (Analysis of Phylogenetics and Evolution), phangorn (Phylogenetic Analysis in R) y phyclust (Phylogenetic Clustering), paquetes del lenguaje y ambiente de cómputo R que nos darán información relevante sobre las relaciones filogenéticas dentro y fuera de especie. |
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