Etude des propriétés de tolérance au déficit hydrique et au stress salin de génotypes appartenant au genre Poncirus et au groupe des mandariniers

L'agrumiculture mondiale est tributaire de l'utilisation de porte-greffes conférant une meilleure adaptation aux contraintes biotiques et abiotiques et assurant une production de qualité. Les orangers trifoliés (Poncirus trifoliata (L.) Raf.) ainsi que leurs hybrides sont couramment utilisés comme porte-greffes en raison de leur immunité envers le virus de la Tristeza, alors que les génotypes du genre Citrus, comme les mandariniers, sont utilisés pour conférer des tolérances au stress abiotiques (calcaire, salinité). La diversité du genre Poncirus semble peu importante et l'évaluation d'une certaine variabilité des comportements dans les conditions de stress abiotique sont très restreintes. Chez les mandariniers, les mandariniers acides sont souvent utilisés comme porte-greffes ou comme géniteurs de porte-greffes. Les mandariniers doux sont, quant à eux, exploités dans les programmes de création de variétés productrices sans pour autant connaître leurs niveaux de tolérance aux stress abiotiques. Dans le cadre de cette thèse, nous avons étudié la tolérance au déficit hydrique et au stress salin de génotypes représentatifs d'une part de la diversité des Poncirus et des mandariniers. A partir de l'analyse de la diversité génétique des 74 accessions de Poncirus de la collection INRA-CIRAD de San Giuliano révélée par marquage SSR et par le phénotype de taille des graines, des feuilles et des fleurs, nous avons établi une classification en 4 groupes génétiques dont un correspondant aux tétraploïdes. Puis sur une sélection d'accessions de ces différents groupes, nous avons étudié la physiologie de ces plants soumis à un déficit hydrique. Dans une autre expérience, nous avons caractérisé les propriétés de tolérance au stress salin de 16 accessions de mandariniers sélectionnés parmi les différents groupes de diversité moléculaire. Cette étude a été conduite sur des plants cultivés sur leurs racines et sur des rameaux sectionnés soumis au stress salin et pour lesquels plusieurs paramètres physiologiques (photosynthèse, conductance stomatique... ) et biochimiques (dosage des chlorures et des activités du système antioxydant... ) ont été mesurés. Dans l'expérience sur les Poncirus, la diversité s'organise essentiellement autour de deux groupes génétiques clairement distincts au niveau moléculaire et aussi morphologique. A l'intérieur de chaque groupe, la diversité ne résulterait que de la mutation ou de la variation ploïdique. De plus, les génotypes appartenant au groupe génétique 1 (appelé " grande fleur ") sont relativement plus sensibles au déficit hydrique que les génotypes du groupe 2 (appelé " petite fleur "). Dans l'expérience du stress salin sur les mandariniers, la tolérance est de même nature quelle que soit la classification " doux "/" acide " de la variété. Il semble néanmoins que les mandariniers ayant hérité des portions de génomes de C. maxima ou de Papeda présentent une meilleure tolérance à la salinité. L'expérimentation sur rameaux isolés permet d'étudier directement les réactions cellulaires au niveau foliaire en contournant l'effet racinaire sur l'absorption des sels. Ainsi nous avons observé de la tolérance chez les variétés ayant de fortes concentrations foliaires en Cl-. L'implication de mécanismes spécifiques pouvant expliquer la meilleure tolérance est également discutée. A partir de ces trois expérimentations présentées sous forme de trois articles, une sélection de génotypes est proposée pour qu'ils soient utilisés dans les programmes d'amélioration.

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Bibliographic Details
Main Author: Ben Yahmed, Jihane
Format: thesis biblioteca
Language:fre
Published: Montpellier SupAgro
Subjects:F30 - Génétique et amélioration des plantes, F60 - Physiologie et biochimie végétale, H50 - Troubles divers des plantes, clémentine, Poncirus trifoliata, rendement des cultures, Citrus reticulata, tétraploïdie, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_9895, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6103, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_10176, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1646, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7690,
Online Access:http://agritrop.cirad.fr/572885/
http://agritrop.cirad.fr/572885/1/document_572885.pdf
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Description
Summary:L'agrumiculture mondiale est tributaire de l'utilisation de porte-greffes conférant une meilleure adaptation aux contraintes biotiques et abiotiques et assurant une production de qualité. Les orangers trifoliés (Poncirus trifoliata (L.) Raf.) ainsi que leurs hybrides sont couramment utilisés comme porte-greffes en raison de leur immunité envers le virus de la Tristeza, alors que les génotypes du genre Citrus, comme les mandariniers, sont utilisés pour conférer des tolérances au stress abiotiques (calcaire, salinité). La diversité du genre Poncirus semble peu importante et l'évaluation d'une certaine variabilité des comportements dans les conditions de stress abiotique sont très restreintes. Chez les mandariniers, les mandariniers acides sont souvent utilisés comme porte-greffes ou comme géniteurs de porte-greffes. Les mandariniers doux sont, quant à eux, exploités dans les programmes de création de variétés productrices sans pour autant connaître leurs niveaux de tolérance aux stress abiotiques. Dans le cadre de cette thèse, nous avons étudié la tolérance au déficit hydrique et au stress salin de génotypes représentatifs d'une part de la diversité des Poncirus et des mandariniers. A partir de l'analyse de la diversité génétique des 74 accessions de Poncirus de la collection INRA-CIRAD de San Giuliano révélée par marquage SSR et par le phénotype de taille des graines, des feuilles et des fleurs, nous avons établi une classification en 4 groupes génétiques dont un correspondant aux tétraploïdes. Puis sur une sélection d'accessions de ces différents groupes, nous avons étudié la physiologie de ces plants soumis à un déficit hydrique. Dans une autre expérience, nous avons caractérisé les propriétés de tolérance au stress salin de 16 accessions de mandariniers sélectionnés parmi les différents groupes de diversité moléculaire. Cette étude a été conduite sur des plants cultivés sur leurs racines et sur des rameaux sectionnés soumis au stress salin et pour lesquels plusieurs paramètres physiologiques (photosynthèse, conductance stomatique... ) et biochimiques (dosage des chlorures et des activités du système antioxydant... ) ont été mesurés. Dans l'expérience sur les Poncirus, la diversité s'organise essentiellement autour de deux groupes génétiques clairement distincts au niveau moléculaire et aussi morphologique. A l'intérieur de chaque groupe, la diversité ne résulterait que de la mutation ou de la variation ploïdique. De plus, les génotypes appartenant au groupe génétique 1 (appelé " grande fleur ") sont relativement plus sensibles au déficit hydrique que les génotypes du groupe 2 (appelé " petite fleur "). Dans l'expérience du stress salin sur les mandariniers, la tolérance est de même nature quelle que soit la classification " doux "/" acide " de la variété. Il semble néanmoins que les mandariniers ayant hérité des portions de génomes de C. maxima ou de Papeda présentent une meilleure tolérance à la salinité. L'expérimentation sur rameaux isolés permet d'étudier directement les réactions cellulaires au niveau foliaire en contournant l'effet racinaire sur l'absorption des sels. Ainsi nous avons observé de la tolérance chez les variétés ayant de fortes concentrations foliaires en Cl-. L'implication de mécanismes spécifiques pouvant expliquer la meilleure tolérance est également discutée. A partir de ces trois expérimentations présentées sous forme de trois articles, une sélection de génotypes est proposée pour qu'ils soient utilisés dans les programmes d'amélioration.