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Identificação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1para obtençao de marcas associadas à resistência do cacaueiro a vassoura-de-bruxa : [Resumo]
A vassoura-de-bruxa causada pelo fungo #Moniliophthora perniciosa# é a doença de maior impacto na cacauicultura no Brasil. Sua principal forma de controle é a utilização de clones resistentes, porém é preciso aumentar a base genética nos plantios comerciais para que se tenha uma resistência mais duradoura. O principal objetivo do Programa de Melhoramento do Cacaueiro do CEPEC/CEPLAC é a piramidação de diferentes genes de resistência, visando aumentar a eficiência e a durabilidade da resistência (PIRES et al., 1996). O objetivo deste estudo foi a busca de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) em genes de resistência a vassoura-de-bruxa, com o intuito de aplicar o mais diretamente possível o resultado dos estudos moleculares à seleção de cacaueiros duravelmente resistentes a M. perniciosa. Os SNPs são resultantes de mutações pontuais e se definem como um loco para o qual encontramos dois alelos em uma freqüência mínima de 1%. A partir de 153 genes de resistência identificados na biblioteca de TSH1188, foram desenhados 73 primers para identificação e validação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1 por seqüenciamento do produto de PCR amplificado. Inicialmente foi feita à otimização da temperatura de 38 primers. Esses primers foram amplificados e seqüenciados nos progenitores SCA6 e ICS1, na F1 TSH516 e no TSH1188. Dos 38 primers,16 foram seqüenciados, sendo 9 monomórficos e 7 polimórficos. O resultado do seqüenciamento foi analisado através do programa CLUSTAL W, onde foi possível a obtenção de 286 SNPs; uma proporção de aproximadamente 51 SNPs para cada gene de resistência onde foi detectado SNP. Foram encontrados SNPs em importantes genes de defesa, como o Cf9_Rapidly Elicited protein, Disease resistance protein, Beta 1,3 - glucanase, e o maior numero de SNPs foi encontrado no gene Pathogenesis-related protein 4B, com 112 SNPs. Este resultado é bastante promissor considerando que SNPs identificados por sequenciamento, normalmente já se encontram validados. Conclui-se que a identificação de SNPs em #Theobroma cacao# mostra-se uma ferramenta promissora para a geração de marcas relacionadas à resistência a vassoura-de-bruxa. (Texte intégral)
| Main Authors: | , , , , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | conference_item biblioteca |
| Language: | por |
| Published: |
s.n.
|
| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, H20 - Maladies des plantes, Moniliophthora, Theobroma cacao, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_31727, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7713, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1070, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/558714/ http://agritrop.cirad.fr/558714/1/document_558714.pdf |
| Tags: |
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| Summary: | A vassoura-de-bruxa causada pelo fungo #Moniliophthora perniciosa# é a doença de maior impacto na cacauicultura no Brasil. Sua principal forma de controle é a utilização de clones resistentes, porém é preciso aumentar a base genética nos plantios comerciais para que se tenha uma resistência mais duradoura. O principal objetivo do Programa de Melhoramento do Cacaueiro do CEPEC/CEPLAC é a piramidação de diferentes genes de resistência, visando aumentar a eficiência e a durabilidade da resistência (PIRES et al., 1996). O objetivo deste estudo foi a busca de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) em genes de resistência a vassoura-de-bruxa, com o intuito de aplicar o mais diretamente possível o resultado dos estudos moleculares à seleção de cacaueiros duravelmente resistentes a M. perniciosa. Os SNPs são resultantes de mutações pontuais e se definem como um loco para o qual encontramos dois alelos em uma freqüência mínima de 1%. A partir de 153 genes de resistência identificados na biblioteca de TSH1188, foram desenhados 73 primers para identificação e validação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1 por seqüenciamento do produto de PCR amplificado. Inicialmente foi feita à otimização da temperatura de 38 primers. Esses primers foram amplificados e seqüenciados nos progenitores SCA6 e ICS1, na F1 TSH516 e no TSH1188. Dos 38 primers,16 foram seqüenciados, sendo 9 monomórficos e 7 polimórficos. O resultado do seqüenciamento foi analisado através do programa CLUSTAL W, onde foi possível a obtenção de 286 SNPs; uma proporção de aproximadamente 51 SNPs para cada gene de resistência onde foi detectado SNP. Foram encontrados SNPs em importantes genes de defesa, como o Cf9_Rapidly Elicited protein, Disease resistance protein, Beta 1,3 - glucanase, e o maior numero de SNPs foi encontrado no gene Pathogenesis-related protein 4B, com 112 SNPs. Este resultado é bastante promissor considerando que SNPs identificados por sequenciamento, normalmente já se encontram validados. Conclui-se que a identificação de SNPs em #Theobroma cacao# mostra-se uma ferramenta promissora para a geração de marcas relacionadas à resistência a vassoura-de-bruxa. (Texte intégral) |
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