DNA methylation and somaclonal variation in oil palm
Environ 5% de palmiers issus de la régénération de palmiers à huile par embryogenèse somatique présentent une anomalie florale "mantled". Des études préliminaires du niveau de ploïdie et du polymorphisme génétique (par RAPD) n'ont révélé aucun changement génomique pouvant être lié au phénotype des variants. Aussi une origine épigénétique a été envisagée pour ce phénomène. Dans cette optique, les auteurs ont évalué le taux de méthylation de l'ADN génomique chez des régénérants normaux et variants à l'aide de deux méthodes complémentaires : 1) par hydrolyse enzymatique de l'ADN génomique des feuilles et des cals embryogènes (cals compacts nodulaires (CCN) qui régénèrent des palmiers normaux à 95%, et cals à croissance rapide (CCR) qui régénèrent des individus "mantled" à 100%) et analyse par HPLC des nucléosides; 2) par la méthode SssI-Methylase Accepting Assay (SssI-MAA), basée sur la saturation enzymatique des sites CG par des groupements méthyle
Summary: | Environ 5% de palmiers issus de la régénération de palmiers à huile par embryogenèse somatique présentent une anomalie florale "mantled". Des études préliminaires du niveau de ploïdie et du polymorphisme génétique (par RAPD) n'ont révélé aucun changement génomique pouvant être lié au phénotype des variants. Aussi une origine épigénétique a été envisagée pour ce phénomène. Dans cette optique, les auteurs ont évalué le taux de méthylation de l'ADN génomique chez des régénérants normaux et variants à l'aide de deux méthodes complémentaires : 1) par hydrolyse enzymatique de l'ADN génomique des feuilles et des cals embryogènes (cals compacts nodulaires (CCN) qui régénèrent des palmiers normaux à 95%, et cals à croissance rapide (CCR) qui régénèrent des individus "mantled" à 100%) et analyse par HPLC des nucléosides; 2) par la méthode SssI-Methylase Accepting Assay (SssI-MAA), basée sur la saturation enzymatique des sites CG par des groupements méthyle |
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