Comparative genome mapping of sugar cane with other species within the Andropogoneae tribe
La cartographie comparée à l'intérieur de la tribu des Andropogoneae a progressé récemment avec le développement des sondes genomiques cartographiées de maïs, pouvant être utilisées sur les genomes de sorgho et de canne à sucre. Les régions synténiques du genome de ces 3 espèces sont identifiées grâce à la cartographie d'un jeu de sondes commun. Il semble qu'il y ait des réarrangements chromosomiques communs entre le maïs et la canne à sucre et entre le maïs et le sorgho. A cet égard, la canne à sucre et le sorgho semblent plus proches que la canne à sucre et le maïs, de même que le sorgho et le maïs. Une analyse plus détaillée de 2 groupements de synténie a été réalisée pour comparer l'ordre des gènes et les taux de recombinaison associés chez ces 3 espèces : dans les 3 genomes, il y a une bonne colinéarité pour les régions chromosomiques concernées; les distances entre gènes sont équivalentes chez le maïs et le sorgho, alors que la canne à sucre tend à montrer moins de recombinaison, au moins pour la descendance analysée
| Main Authors: | , , , , , |
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| Format: | article biblioteca |
| Language: | eng |
| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, Saccharum, Sorghum bicolor, Zea mays, génie génétique, adn, génome, gène, carte génétique, polymorphisme génétique, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6725, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7247, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_8504, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3214, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24031, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/387295/ http://agritrop.cirad.fr/387295/1/ID387295.pdf |
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| Summary: | La cartographie comparée à l'intérieur de la tribu des Andropogoneae a progressé récemment avec le développement des sondes genomiques cartographiées de maïs, pouvant être utilisées sur les genomes de sorgho et de canne à sucre. Les régions synténiques du genome de ces 3 espèces sont identifiées grâce à la cartographie d'un jeu de sondes commun. Il semble qu'il y ait des réarrangements chromosomiques communs entre le maïs et la canne à sucre et entre le maïs et le sorgho. A cet égard, la canne à sucre et le sorgho semblent plus proches que la canne à sucre et le maïs, de même que le sorgho et le maïs. Une analyse plus détaillée de 2 groupements de synténie a été réalisée pour comparer l'ordre des gènes et les taux de recombinaison associés chez ces 3 espèces : dans les 3 genomes, il y a une bonne colinéarité pour les régions chromosomiques concernées; les distances entre gènes sont équivalentes chez le maïs et le sorgho, alors que la canne à sucre tend à montrer moins de recombinaison, au moins pour la descendance analysée |
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