Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019
Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256μg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like. Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles.
| Main Authors: | , , , , , , , , , |
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| Format: | article biblioteca |
| Language: | spa |
| Published: |
Pan American Health Organization
2020
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| Subjects: | Investigación agropecuaria - A50, Streptococcus faecalis, Farmacología, Ganadería y especies menores, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_16605, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5760, |
| Online Access: | https://iris.paho.org/handle/10665.2/52679 http://hdl.handle.net/20.500.12324/39670 https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 |
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| Summary: | Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores
de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto
Nacional de Salud de Colombia.
Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes
al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración
inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La
diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis
aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo.
Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia.
Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256μg/mL. La tipificación por Diversilab®
indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del
genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA
y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos
y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos
optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos
aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like.
Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes
clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles. |
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