Transferibilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de RNA-Seq de amendoim forrageiro.

O amendoim forrageiro (Arachis pintoi) apresenta destaque expressivo que traduz a sua importância econômica e ambiental em pastagens. Porém, ainda são poucas as variedades disponíveis para cultivo. O uso de marcadores moleculares baseados em RNA-Seq é vantajoso, pois são derivados de genes que podem estar relacionados com características fenotípicas de interesse agronômico. Assim, o objetivo deste trabalho foi testar a transferibilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de RNA-Seq de Arachis pintoi para Arachis repens e o amendoim comum (Arachis hypogaea L.). Trinta e três locos microssatélites foram analisados, dos quais 28 apresentaram amplificação em todas as espécies. Tal resultado indica que esses locos são altamente conservados. A maior taxa de transferibilidade foi observada em A. repens (100%), espécie pertencente à mesma secção taxonômica que A. pintoi. Cinco locos amplificaram apenas em A. repens. Isso sugere alterações nas regiões flanqueadoras dos locos em A. hypogaea, impedindo o anelamento correto dos primers. Em A. hypogaea a taxa foi de 84,85%. A anotação funcional dos locos identificou similaridade com proteínas relacionadas ao crescimento, desenvolvimento e diferenciação de células e tecidos, e resistência a patógenos. Esses dados indicam o potencial informativo dos novos locos e podem ser usados em programas de melhoramento.

Bibliographic Details

Main Authors:	OLIVEIRA, J. C. de, SILVA, A. L. D. da, SILVA, C. C. da, SOUZA, A. P. de, FORMIGHIERI, E. F., SILVA, L. M. da, CAMPOS, T. de
Other Authors:	JÔNATAS CHAGAS DE OLIVEIRA, Universidade Federal do Acre (Ufac); ANDRÉ LUCAS DOMINGOS DA SILVA, Universidade Federal do Acre (Ufac); CARLA CRISTINA DA SILVA, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); ANETE PEREIRA DE SOUZA, Universidade Estadual de Campinas (Unnicamp); EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; LUCIELIO MANOEL DA SILVA, CPAF-AC; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC.
Format:	Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:	Portugues pt_BR
Published:	2022-01-26
Subjects:	Amendoim forrageiro, Forage peanut, Cacahuetes forrajeros, RNA-Seq, Taxa de transferibilidade, Transfer rate, Leguminosas forrajeras, Arachis repens, Goobers, Acre, Amazônia Ocidental, Western Amazon, Amazonia Occidental, Melhoramento Genético Vegetal, Leguminosa Forrageira, Marcador Molecular, Seleção Fenótipa, Arachis Hypogaea, Plant breeding, Forage legumes, Arachis pintoi, Genetic markers,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139348
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