Otimização de iniciadores (primers) de loci microssatélites obtidos a partir do transcritoma de Urochloa decumbens.
Urochloa decumbens (Sinonímia Brachiaria decumbens) é conhecida pela sua alta produtividade e adaptabilidade em solos ácidos e de baixa fertilidade. Apesar de destaque na pecuária de corte nacional, estudos genéticos sobre a espécie ainda são um fator limitante para os programas de melhoramento genético, uma vez que a reprodução prevalecente é a apomítica e os indivíduos podem se apresentar de diploides a pentaploides. A recente técnica de RNA-Seq utilizada para sequenciamento de transcritomas, proporciona a identificação de marcadores moleculares do tipo microssatélites presentes em regiões funcionais do genoma, relacionados a características agronômicas importantes o que pode levar a maior eficiência em programas de melhoramento genético. O objetivo deste estudo foi otimizar as condições de amplificação de pares de primers de loci microssatélites obtidos a partir do transcritoma de U. decumbens, para posterior caracterização em géis de poliacrilamida. Para isto, foi extraído o DNA de quatro plantas do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Gado de Corte, sendo duas diploides e duas tetraploides, e estes foram usados para otimização de 100 pares de primers, por meio da amplificação da região microssatélite via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase).
| Main Authors: | , , , , |
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| Other Authors: | |
| Format: | Anais e Proceedings de eventos biblioteca |
| Language: | pt_BR por |
| Published: |
2017-01-30
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| Subjects: | Braquiarinha, SSR, Planta forrageira, Marcador molecular, |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062136 |
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| Summary: | Urochloa decumbens (Sinonímia Brachiaria decumbens) é conhecida pela sua alta produtividade e adaptabilidade em solos ácidos e de baixa fertilidade. Apesar de destaque na pecuária de corte nacional, estudos genéticos sobre a espécie ainda são um fator limitante para os programas de melhoramento genético, uma vez que a reprodução prevalecente é a apomítica e os indivíduos podem se apresentar de diploides a pentaploides. A recente técnica de RNA-Seq utilizada para sequenciamento de transcritomas, proporciona a identificação de marcadores moleculares do tipo microssatélites presentes em regiões funcionais do genoma, relacionados a características agronômicas importantes o que pode levar a maior eficiência em programas de melhoramento genético. O objetivo deste estudo foi otimizar as condições de amplificação de pares de primers de loci microssatélites obtidos a partir do transcritoma de U. decumbens, para posterior caracterização em géis de poliacrilamida. Para isto, foi extraído o DNA de quatro plantas do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Gado de Corte, sendo duas diploides e duas tetraploides, e estes foram usados para otimização de 100 pares de primers, por meio da amplificação da região microssatélite via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase). |
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