Transcriptoma do cafeeiro (Coffea arabica L.) na interação com Hemileia vastatrix Berk. & BR.

Os estudos de transcriptoma revelam a expressão de determinados genes na célula em uma condição biológica específica. Em um patossistema, entender a expressão gênica é essencial para a identificação dos genes relacionados com os mecanismos de defesa e resistência da planta, que são ativados pela presença do patógeno, bem como dos genes de patogenicidade do microrganismo. Para estudar o transcriptoma de um organismo, o método que tem sido utilizado é o sequenciamento de nova geração de mRNA, denominado RNA-seq. Esta abordagem permite monitorar a expressão de genes dos dois organismos em diferentes etapas ao longo do processo infeccioso. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do cafeeiro durante a interação com Hemileia vastatrix, fungo causador da ferrugem, a fim de identificar os genes que são ativados ou reprimidos em resposta à infecção.

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Bibliographic Details
Main Authors: FLOREZ, J. C., CAIXETA, E. T., FREITAS, R. do L., MOFATO, L. S., FALSARELLA CARAZZOLE, M., ZAMBOLIM, L.
Other Authors: JUAN CARLOS FLOREZ, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; REJANE DO LIVRAMENTO FREITAS, UFV; LUCIANA SOUTO MOFATO, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UFV.
Format: Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2016-03-18
Subjects:Ferrugem do cafeeiro, Sequenciamento de nova geração, RNA-seq, Ferrugem, Café, Variedade resistente,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1041487
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Summary:Os estudos de transcriptoma revelam a expressão de determinados genes na célula em uma condição biológica específica. Em um patossistema, entender a expressão gênica é essencial para a identificação dos genes relacionados com os mecanismos de defesa e resistência da planta, que são ativados pela presença do patógeno, bem como dos genes de patogenicidade do microrganismo. Para estudar o transcriptoma de um organismo, o método que tem sido utilizado é o sequenciamento de nova geração de mRNA, denominado RNA-seq. Esta abordagem permite monitorar a expressão de genes dos dois organismos em diferentes etapas ao longo do processo infeccioso. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do cafeeiro durante a interação com Hemileia vastatrix, fungo causador da ferrugem, a fim de identificar os genes que são ativados ou reprimidos em resposta à infecção.