Caracterização genética de isolados de nódulos de feijoeiro pela técnica de BOX - PCR.
O conhecimento sobre a diversidade de rizóbios que nodulam o feijoeiro (Phaseolus vulgaris L)ainda é bastante limitado em solos brasileiros, apesar dos avanços verificados nos últimos anos. Nesse contexto, a caracterização genética de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro contribui não somente para conhecimento da biodiversidade de bactérias em solos brasileiros, como também para buscar estratégias que visem maximizar o processo de fixação biológica do nitrogênio na cultura, com reflexos na produtividade de grãos, nos custos para o agricultor e que apresentem menor impacto ambiental. A amplificação do DNA de rizóbios por PCR com o primer BOX (5'-CTACGGCAAGGCGACGCTGACG-3'), que amplifica regiões conservadas e repetitivas do DNA cromossômico bacteriano,se apresenta como uma técnica sensível para estudos iniciais de caracterização genética de isolados bacterianos. Essa metodologia resulta em bandas definidas, em número elevado e com repetitividade, representando um fingerprinting confiável e de baixo custo. Neste estudo, foram caracterizadas 39 bactérias isoladas de nódulos de plantas do feijoeiro, provenientes de diversos locais do Mato Grosso do Sul, além das bactérias referência de Rhizobium, utilizadas como comparação. Diversos resultados de literatura com BOX PCR demonstram que as estirpes da mesma espécie em geral apresentam similaridade superior a 70% na análise de BOX-PCR. Foram observados diversos agrupamentos, apresentando similaridade superior e inferior a 70%, indicando portanto, diversidade entre e interespécies. Considerando o nível de 70% de similaridade, foram observados 24 diferentes agrupamentos, ou estirpes ocupando posição isolada. O nível de diversidade genética detectado foi elevado, com o agrupamento final mostrando similaridade de perfis inferior a 30%. Desse modo, a técnica de BOX?PCR mostrou-se eficaz para a detecção da diversidade genética de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro. A partir do dendrograma obtido por BOX-PCR, foram selecionadas estirpes representantes dos principais grupos para a realização de outras análises genotípicas e fenotípicas.
Main Authors: | , , , |
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Other Authors: | |
Format: | Anais e Proceedings de eventos biblioteca |
Language: | pt_BR pt_BR |
Published: |
2015-03-05
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Subjects: | Feijão, Beans, |
Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010711 |
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Summary: | O conhecimento sobre a diversidade de rizóbios que nodulam o feijoeiro (Phaseolus vulgaris L)ainda é bastante limitado em solos brasileiros, apesar dos avanços verificados nos últimos anos. Nesse contexto, a caracterização genética de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro contribui não somente para conhecimento da biodiversidade de bactérias em solos brasileiros, como também para buscar estratégias que visem maximizar o processo de fixação biológica do nitrogênio na cultura, com reflexos na produtividade de grãos, nos custos para o agricultor e que apresentem menor impacto ambiental. A amplificação do DNA de rizóbios por PCR com o primer BOX (5'-CTACGGCAAGGCGACGCTGACG-3'), que amplifica regiões conservadas e repetitivas do DNA cromossômico bacteriano,se apresenta como uma técnica sensível para estudos iniciais de caracterização genética de isolados bacterianos. Essa metodologia resulta em bandas definidas, em número elevado e com repetitividade, representando um fingerprinting confiável e de baixo custo. Neste estudo, foram caracterizadas 39 bactérias isoladas de nódulos de plantas do feijoeiro, provenientes de diversos locais do Mato Grosso do Sul, além das bactérias referência de Rhizobium, utilizadas como comparação. Diversos resultados de literatura com BOX PCR demonstram que as estirpes da mesma espécie em geral apresentam similaridade superior a 70% na análise de BOX-PCR. Foram observados diversos agrupamentos, apresentando similaridade superior e inferior a 70%, indicando portanto, diversidade entre e interespécies. Considerando o nível de 70% de similaridade, foram observados 24 diferentes agrupamentos, ou estirpes ocupando posição isolada. O nível de diversidade genética detectado foi elevado, com o agrupamento final mostrando similaridade de perfis inferior a 30%. Desse modo, a técnica de BOX?PCR mostrou-se eficaz para a detecção da diversidade genética de rizóbios microssimbiontes do feijoeiro. A partir do dendrograma obtido por BOX-PCR, foram selecionadas estirpes representantes dos principais grupos para a realização de outras análises genotípicas e fenotípicas. |
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