Código de barras de la vida y análisis filogenético en Dasylirion cedrosanum y D. berlandieri con base en secuencias de DNA citoplasmático
"El presente trabajo se realizó con el objetivo de evaluar la utilidad de dos regiones del cloroplasto (rbcL y matK) propuestas como código de identificación genética para la discriminación e identificación de las especies Dasylirion cedrosanum y D. berlandieri. Se usó DNA de cinco plantas para cada una de las dos especies, así como de una población de especie desconocida de una localidad al Sureste de Coahuila. Por medio de PCR se llevó a cabo la amplificación de las regiones rbcL y matK, las cuales se secuenciaron y posteriormente se depuraron mediante la alineación de las secuencias derecha e izquierda, así como el análisis de los electroferogramas y la traducción de la secuencia. Mediante la ayuda de los paquetes seqinr, ape y spider del ambiente y lenguaje de cómputo estadístico R se obtuvieron secuencias consenso para cada especie y se realizaron los análisis filogenéticos necesarios, mientras que la depuración y análisis de secuencias se llevaron a cabo con los softwares Clustalx y FinchTV, todos de acceso libre. Los resultados obtenidos a partir de los análisis filogenéticos no mostraron variación intraespecífica para ninguna de las secuencias, y se logró discriminar entre las especies D. cedrosanum y D. berlandieri a partir de la detección de siete substituciones en 866 nucleótidos para el gen matK, y de la detección de una substitución en 519 nucleótidos para el gen rbcL. Ambas especies se compararon con D. wheeleri y D. serratifolium, que son las únicas reportadas en el sistema BOLD. Los análisis comparativos, mostraron una cercanía genética entre las especies D. wheeleri y D. serratifolium, las cuales a su vez se alejan de D. cedrosanum y D. berlandieri. El presente trabajo demuestra la utilidad de los genes citoplasmáticos rbcL y matK, para distinguir entre las especies del género Dasylirion, especialmente matk"
| Main Authors: | , , , |
|---|---|
| Format: | Texto biblioteca |
| Language: | eng |
| Published: |
Saltillo, Coahuila, México Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro
2015
|
| Subjects: | Sotol, Dasylirion serratifolium, |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Summary: | "El presente trabajo se realizó con el objetivo de evaluar la utilidad de dos regiones del cloroplasto (rbcL y matK) propuestas como código de identificación genética para la discriminación e identificación de las especies Dasylirion cedrosanum y D. berlandieri. Se usó DNA de cinco plantas para cada una de las dos especies, así como de una población de especie desconocida de una localidad al Sureste de Coahuila. Por medio de PCR se llevó a cabo la amplificación de las regiones rbcL y matK, las cuales se secuenciaron y posteriormente se depuraron mediante la alineación de las secuencias derecha e izquierda, así como el análisis de los electroferogramas y la traducción de la secuencia. Mediante la ayuda de los paquetes seqinr, ape y spider del ambiente y lenguaje de cómputo estadístico R se obtuvieron secuencias consenso para cada especie y se realizaron los análisis filogenéticos necesarios, mientras que la depuración y análisis de secuencias se llevaron a cabo con los softwares Clustalx y FinchTV, todos de acceso libre. Los resultados obtenidos a partir de los análisis filogenéticos no mostraron variación intraespecífica para ninguna de las secuencias, y se logró discriminar entre las especies D. cedrosanum y D. berlandieri a partir de la detección de siete substituciones en 866 nucleótidos para el gen matK, y de la detección de una substitución en 519 nucleótidos para el gen rbcL. Ambas especies se compararon con D. wheeleri y D. serratifolium, que son las únicas reportadas en el sistema BOLD. Los análisis comparativos, mostraron una cercanía genética entre las especies D. wheeleri y D. serratifolium, las cuales a su vez se alejan de D. cedrosanum y D. berlandieri. El presente trabajo demuestra la utilidad de los genes citoplasmáticos rbcL y matK, para distinguir entre las especies del género Dasylirion, especialmente matk" |
|---|