Validación experimental de dos aproximaciones computacionales para la predicción de proteínas de adhesión de toxoplasma gondii.
Toxoplasma gondii es un protozoo parasito que invade todas las células nucleadas de la gran mayoría de vertebrados endotérmicos. Para llevar a cabo este proceso, los taquizoitos utilizan una maquinaria proteica que les permite reconocer, adherirse y penetrar activamente las células hospederas impulsados por un motor de actina y miosina. Dada la amplia gama de células y hospederos que T. gondii puede infectar, se espera que los taquizoitos expresen una gran variedad de ligandos (adhesinas) que les permitan unirse a los receptores presentes en la matriz extracelular y en la membrana de las células hospederas durante los procesos de migración e invasión. Aproximaciones computacionales basadas en homología y en el uso de maquinas de aprendizaje han sido utilizadas para la predicción de este tipo de proteínas en T.gondii y en otros Apicomplexos explotando la información derivada de los proyectos genoma. Sin embargo, muchas de estas predicciones no han sido validadas por ensayos in vitro. Por esta razón, se propone elegir proteínas adhesinas predichas por métodos basados en homología y por maquinas de aprendizaje y realizar ensayos de unión a células para validar su función. Esto permitir identificar el método más adecuado para la predicción de este tipo de proteínas, consideradas importantes blancos terapéuticos y para vacuna.
| Main Author: | |
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| Format: | Informe de investigación biblioteca |
| Language: | spa |
| Published: |
Universidad del Quindío
2013-04-23
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| Subjects: | Bioinformática, Invasión, Parásito, Toxoplasma, |
| Online Access: | https://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40354 |
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