Étude du contrôle génétique de critères de qualité organoleptique et fonctionnelle des fruits chez le bananier
Les caractéristiques de qualité des fruits sont directement liées à leur aptitude à la commercialisation et à l'acceptabilité par le consommateur, et sont donc des cibles clés pour les programmes de sélection des bananiers. La difficulté à combiner ces critères, notamment avec ceux de tolérance aux maladies et de rendement, limite actuellement l'adoption de nouveaux hybrides. Cette thèse a pour objectif d'explorer le contrôle génétique de caractères liés à la qualité du fruit, aussi bien organoleptique que fonctionnelle, au travers d'une étude d'héritabilité et une cartographie de QTL afin à terme de faciliter l'amélioration variétale des bananiers. Nous avons tout d'abord étudié la variabilité de trois traits de qualité organoleptiques majeurs : l'acidité de la pulpe (pH), sa fermeté (FEP) et sa teneur en matière sèche (TMS). Nous nous sommes ensuite intéressés à la variabilité du dégrain (DE), qui correspond à la force de rupture du pédoncule du fruit, en relation avec des critères de maturation du fruit. Ces critères ont été suivis sur une période de mûrissement de 7 jours et durant trois cycles de production dans une population en ségrégation de 162 bananiers diploïdes, issus du croisement P. Madu x Galéo. L'ensemble des caractères présente des niveaux de variabilité importants et de bons niveaux d'héritabilité, avec des valeurs de 0.77, 0.46, 0.81 et 0.64 pour le pH, la FEP, le TMS, et le DE, respectivement. La recherche de QTL par multiple-QTL mapping (MQM) a été réalisée sur deux cartes parentales, d'une part sur l'ensemble des données pour chaque jour de murissement afin d'étudier leur dynamique, et d'autre part sur les jeux de données spécifiques aux trois cycles de production afin d'évaluer leur stabilité. Des QTL majeurs (LOD ≥ 3, R² ≥ 15%) ont été détectés pour chacun de ces critères. Des QTL spécifiques d'un stade de mûrissement et d'un cycle de production ont été détectés en majorité, mais aussi de nombreuses zones de co-localisation de QTL. Pour certains critères, une méta- analyse a été effectuée pour confirmer ces co-localisations d'une part, et pour affiner les intervalles de confiance d'autre part. Les QTL les plus intéressants en lien avec l'acidité de la pulpe (R² = 19,3- 50,6%) et la FRP (R² = 16.9-18.9%) ont été détectés sur le LG1_7 de la carte génétique de Pisang Madu. Ce cultivar présente un fort taux d'apparentement à Cavendish, le groupe de cultivars de bananes dessert le plus cultivé au monde. Ces QTL sont situés sur le chromosome 1T7 qui est issu d'une translocation réciproque, qui est présent à l'état hétérozygote chez Pisang Madu et qui ne recombine pas sur une large partie, ce qui constitue un contexte favorable au suivi par marqueurs moléculaires. Les effets des QTL détectés devront être vérifiés dans différents fonds génétiques et environnements. Ces premiers résultats fournissent une base de réflexion intéressante pour l'optimisation des stratégies de création variétale, et pour envisager la sélection assistée par marqueurs dans les programmes d'amélioration des bananiers.
| Main Author: | |
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| Format: | thesis biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
Montpellier SupAgro
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| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, Q04 - Composition des produits alimentaires, propriété organoleptique, qualité des aliments, génétique, Musa, locus des caractères quantitatifs, amélioration des plantes, amélioration génétique, critère de sélection, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5399, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_10965, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3222, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4993, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5956, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_49902, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1078, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/601144/ http://agritrop.cirad.fr/601144/9/ID601144.pdf |
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