Análise in silico da expressão gênica de citocromo p450 relacionada ao metabolismo de diterpenos em Coffea : [Resumo]

O Brasil é o maior produtor e exportador de café mundial, além de possuir o segundo maior mercado consumidor. Estudos para melhorar geneticamente a qualidade da bebida e resistência da planta são cada vez mais frequentes e de fundamental importância. Os diterpenos presentes na fração lipídica do grão de café, como o cafestol e o caveol, estão diretamente ligados tanto a propriedades nutracêuticas da bebida como a mecanismos de defesa da planta. O estudo dos genes que controlam a biossíntese dos diterpenos são importantes para compreender as vias metabólicas e as enzimas que controlam o acúmulo/degradação dos mesmos. Os genes da cyt P450 são de uma família multigênica, cujos muitos membros estão envolvidos no metabolismo secundário das plantas, inclusive na síntese de diterpenos. O presente trabalho visa identificar e caracterizar in silico genes de citocromo P450 (Cyt P450) a partir de seqüências ESTs disponibilizadas em projetos de transcriptoma do cafeeiro, com ênfase na identificação de genes candidatos envolvidos no metabolismo de cafestol e caveol. Foram selecionadas 1396 seqüências, provenientes do projeto brasileiro Genoma Café, disponibilizado no banco de dados do LGE Campinas (http://www.lge.ibi.unicamp. br/cafe) e da Universidade de Cornell (LIN et al., 2005). Foram formados 92 contigs e 65 singlets, utilizando-se o programa Codon Code Aligner. Os 92 contigs analisados por BLAST X contra bancos de dados de seqüências públicos (GenBank e HarvEST Coffea), confirmando-se para 91 contigs sua identidade com genes de Cyt P450. A análise in silico por Northen eletrônico revelou níveis e perfis de expressão específicos para cada um dos contigs, permitindo assim a seleção de alguns genes candidatos para análises transcricionais baseados nas diferenças de expressão entre bibliotecas de cDNA com diferentes tecidos (flor, fruto, folha, raiz, etc), e também sob diferentes condições fisiológicas (estressados e não estressados). O presente estudo serve de plataforma para a análise de expressão de cyt P450 candidatas em amostras de RNA de tecidos contrastantes para acúmulo de caveol e cafestol, além de frutos tratados com metil jasmonato, por diferentes metodologias, como o microarranjo (NimbleGen) e por RT-PCR. Apoio financeiro: CNPq e CBP&Café. (Texte intégral)

Bibliographic Details

Main Authors:	Ivamoto, Suzana Tiemi, Pot, David, Ferreira, Lucia Pires, Alves, L.C., Domingues, Douglas S., Vieira, Luiz Gonzaga Esteves, Pereira, Luiz Filipe P.
Format:	conference_item biblioteca
Language:	por
Published:	s.n.
Subjects:	F30 - Génétique et amélioration des plantes, F60 - Physiologie et biochimie végétale,
Online Access:	http://agritrop.cirad.fr/558728/ http://agritrop.cirad.fr/558728/1/document_558728.pdf
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