Revue sur les maladies de type " Jaunissement Mortel " du cocotier. Diversité, variabilité et diagnostic
De par le monde, les cocotiers (Cocos nucifera L.) sont affectés par divers type de jaunissements mortels (JM). Certains de ces syndromes sont causés par des phytoplasmes, petites bactéries impossibles à détecter en microscopie optique. L'amplification d'un gène donné des phytoplasmes par Polymerase Chain Reaction (PCR) est le moyen le plus commode de faire le diagnostic. Le problème, c'est qu'il y a au moins 28 " groupes " de phytoplasmes et une seule paire d'amorces -P1/P7- fréquemment utilisée pour la PCR. Comme ces séquences appartiennent à un gène très conservé, les faux positifs sont fréquents. Il faut donc également utiliser d'autres amorces spécifiques d'une "souche" (ou sous-groupe) - par exemple, LY-F/LY-R pour le JM des Caraïbes, les amorces de Rohde pour la " LD Tanzania ". De telles amorces spécifiques sont parfois restrictives. En effet il existe une variabilité au sein de chaque souche et les séquences des amorces doivent être adaptées à cette variabilité. On connaît à ce jour au moins 5 sous-groupes de JM. Ces sous-groupes sont identifiables par RFLP ou séquençage. En Afrique deux sous-groupes de phytoplasmes associés à des JM ont été identifies.
| Main Authors: | , , |
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| Format: | conference_item biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
CIRAD
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, maladie bactérienne, Cocos nucifera, phytoplasme, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_770, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1716, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_26802, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1320, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_165, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/547418/ http://agritrop.cirad.fr/547418/1/document_547418.pdf |
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