Détection moléculaire de Xanthomonas axonopodis pv.allii dans les semences d'oignon
Le dépérissement bactérien de l'oignon est une maladie émergente au niveau mondial provoquant des dégâts importants. l'agent causal, Xanthomonas axonopodis pv alli (Xaa), est une bactérie phytopathogène séminicole, c'est à dire qu'elle est transmise et propagée par l'intermédiaire des graines. A la Réunion , il a été montré que 4 graines contaminées sur 10 000 suffisaient à induire une épidémie dans des conditions non omptimales. Il semble donc important de contrôler la propagation de la bactérie dans le cadre des échanges internationaux de semences. c'est dans ce but, qu'au cours de ce stage, j'ai contribué à la mise au point d'un test de détection simple, rapide, spécifique est sensible de la bactérie dans les semences. Le test a pour principe d'amplifier par une Nested-PCR Multiplex (une seconde amplification est effectuée sur le produit de la première en utilisant une parier d'amorces interne à la première) deux fragments sépcifiques de Xaa. Ces fragements ont été au préalable repérés par RAPD-PCR, clonés, séquencés, et deux paire d'amorces onté été développées pour en faire des fragments SCARs. Ce test permet de détecter 95% des souches Xaa testées...[résumé auteur]
| Main Author: | |
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| Format: | thesis biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
Université Pierre et Marie Curie
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/521420/ |
| Tags: |
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