Development, characterisation, and across-taxa utility of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) microsatellite markers
Le développement de marqueurs microsatellites du palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.) est présenté du criblage de banques enrichies en séquences répétées simples, de type (GA)n, (GT)n et (CCG)n, à la caractérisation finale de 21 locus microsatellites publiés avec leurs séquences d'amorces, leurs gammes de taille allélique et leurs taux d'hétérozygotie attendus, chez E. guineensis comme chez l'espèce proche E. oleifera vers laquelle une transférabilité optimale des marqueurs a été observée. Une analyse multi-variable montre la capacité des marqueurs à révéler la structure de la diversité génétique du genre Elaeis, en accord avec les origines géographiques connues et les relations génétiques mesurées lors de précédentes études. Les hauts niveaux de variabilité allélique indiquent que les microsatellites de E. guineensis seront un outil puissant pour l'étude génétique du genre Elaeis, dont l'identification variétale et la cartographie génétique intra- ou inter-spécifique. Des tests d'amplification PCR sur 16 autres espèces de Palmae et les séquences d'allèles clonés, informent que les microsatellites de E. guineensis sont des marqueurs potentiellement transférables chez d'autres palmiers. De plus, l'information phénétique obtenue à partir de leurs régions flanquantes font des microsatellites de E. guineensis une source potentielle d'informations moléculaires pour l'étude phylogénétique des taxons de Palmae.
| Main Authors: | , , , , , |
|---|---|
| Format: | article biblioteca |
| Language: | eng |
| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie, Elaeis guineensis, Elaeis oleifera, marqueur génétique, variation génétique, phylogénie, Arecaceae, microsatellite, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2509, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1904, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15975, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_13325, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15807, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_36574, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/481471/ http://agritrop.cirad.fr/481471/1/481471.pdf |
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