Abundance and distribution of simple sequence repeats in the Musaceae family. Microsatellite markers to map the banana genome
Une bibliothèque génomique de Musa, partiellement fractionnée par PstI, et précédemment établie comme source pour des marqueurs RFLP, a été recriblée quant au nombre de séquences dinucléotidiques répétées. Des résultats préliminaires sont donnés concernant les séquences microsatellites de dinucléotides dans le génome bananier. Approximativement un sixième (17 pour cent) des clones de la bibliothèque des gènes bananiers contient au moins un site de microsatellite, comme le confirme le séquençage. Etonnamment, la majorité des séquences répétées dinucléotidiques sont de la famille des séquences (GA)n. Ces microsatellites récemment développés comme marqueurs sur le bananier se sont révélés être abondants et polymorphes (le nombre d'allèles par locus variant entre 11 et 24 sur un échantillon test de 19 accessions représentant les différentes sections de la famille des Musacées). Des protocoles de laboratoire ont été simplifiés, et une procédure d'analyse non radioactive et à haute résolution a été adaptée afin de détecter les allèles des séquences de nombre variable répétées en tandem. Ceci permettra de promouvoir l'exportation des microsatellites comme marqueurs vers les pays en voie de développement
| Main Authors: | , , , , |
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| Format: | conference_item biblioteca |
| Language: | eng |
| Published: |
IAEA
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| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, Musaceae, séquence nucléotidique, marqueur génétique, carte génétique, génome, RFLP, PCR, Rhammatocerus schistocercoides, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4998, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27583, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34255, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34079, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37043, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/388207/ |
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