Assessment of genomic variability in Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, causal agent of mango black spot

Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, agent causal de la maladie des tâches noires de la mangue est la principale menace de cette culture. La structure des populations et la variabilité génétique des souches de Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae ont été étudiées dans ce travail. Les expériences ont consisté à cloner un fragment à partir d'une banque génomique partielle de Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae et utiliser les clones comme sondes pour analyse RFLP entre les différentes souches. Les résultats ont montré que toutes les souches testées se groupent de façon compatible avec leur phénotype ou leur hôte d'origine, quelle que soit la sonde utilisée. Cela suggère que les souches du pathovar sont génétiquement dissemblables et que la classification de certaines d'entre elles dans le pathovar devrait être reconsidérée. L'idée est confirmée selon laquelle la classification du genre Xanthomonas en pathovars ne reflète pas les relations entre souches, et que des caractères génotypiques ou phénotypiques autres que le spectre d'hôte sont plus appropriés pour évaluer la variabilité au sein d'un pathovar

Bibliographic Details

Main Author:	Gagnevin, Lionel
Format:	thesis biblioteca
Language:	eng
Published:	INA-PG
Subjects:	H20 - Maladies des plantes, F30 - Génétique et amélioration des plantes, Mangifera indica, Xanthomonas campestris, maladie bactérienne, biologie moléculaire, marqueur génétique, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4575, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24379, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_770, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4891, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030,
Online Access:	http://agritrop.cirad.fr/324699/
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