Caractérisation des gènes de biosynthèse de l'albicidine et clonage d'un gène de résistance à l'albicidine produite par Xanthomonas albilineans, agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre
"Xanthomonas albilineans# est un agent pathogène inféodé au xylème, responsable de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre. Cette bactérie produit une phytotoxine, l'albicidine, qui inhibe de façon spécifique la réplication des ADN chloroplastiques et bactériens. Trois régions de gènes impliqués dans la biosynthèse de la toxine avaient été identifiées en 1998 chez la souche originaire de Floride Xa23R1 à partir de l'analyse moléculaire de mutants non producteurs d'albicidine obtenus par mutagénèse insertionnelle du transposon #Tn5-GusA# (Rott #et aL#, 1996). Les gènes situés au niveau de ces régions, appelées I, II et III, sont localisés dans des zones respectives de 48, 9 et 3 kb. Ce travail présente la caractérisation de la troisième région de biosynthèse qui, après isolement et clonage chez #E. coli# a permis de restaurer la production de toxine chez deux mutants non producteurs de toxine et non complémentés par les régions I et II. L'analyse de la séquence de la région III et des sites mutés a permis d'identifier cinq ORFs et de proposer une fonction pour quatre d'entre elles (ORF 1, ORF2, ORE 4 et ORF5). Parallèlement, un gène de résistance à l'albicidine, #albE# a récemment été découvert chez une souche australienne de #X. albilineans# (Wall, 1996). Des séquences homologues à ce gène avaient été recherchées en 1998, par PCR dans la souche Xa23R1 au moyen d'amorces définies à partir de la séquence de #alb E#. Au cours de ce travail, plusieurs fragments ont été amplifiés à partir de Xa23R1, mais aucun d'eux ne présentait d'homologie avec la séquence du gène australien. Une séquence homologue au gène australien a donc été recherchée chez une autre souche australienne (Xa126R1) afin d'identifier une sonde pour localiser le gène de résistance dans la souche de Floride Xa23R1. Un fragment PCR d'environ 1 kb présentant une homologie avec #alb E# de 97% sur 767pb a été obtenu.
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | thesis biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
ENSAM
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, Saccharum, Xanthomonas albilineans, phytotoxine, gène, Clonage moléculaire, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6725, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27422, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34323, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3214, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27503, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/300624/ |
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