Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.

Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos.

Bibliographic Details

Main Authors:	IVAMOTO, S. T., REIS JUNIOR, O., CARAZZOLLE, M. F., DOMINGUES, D. S., PEREIRA, L. F. P.
Other Authors:	SUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; OSVALDO REIS JUNIOR, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.
Format:	Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2014-01-08
Subjects:	RNA-Seq, Transcriptoma, Illumina, Coffea arabica,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/975225
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