Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.

A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).

Bibliographic Details

Main Authors:	SOMAVILLA, A. L., HIGA, R. H., MUDADU, M. de A., ALENCAR, M. M. de, REGITANO, L. C. de A., REDE BIFEQUALI
Other Authors:	ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, PÓS-GRADUAÇÃO UNESP/JABOTICAL; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Format:	Separatas biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2012-12-19
Subjects:	Desequilíbrio de ligação, Genotipagem, REHH, Snps., Bos Indicus.,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943057
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