Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem.

O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares relacionados à resistência do cafeeiro (Coffea arabica) à ferrugem (Hemileia vastatrix). Foram identificadas sequências de DNA potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças, por meio de análise ?in silico?, a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. A partir das sequências mineradas, foram desenhados 59 pares de iniciadores para amplificá‑las. Os 59 iniciadores foram testados em 12 cafeeiros resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Vinte e sete iniciadores resultaram em bandas únicas e bem definidas, enquanto um deles amplificou fragmento de DNA em todos os cafeeiros resistentes, mas não nos suscetíveis. Esse marcador molecular polimórfico amplificou uma região do DNA que corresponde a uma janela aberta de leitura parcial do genoma de C. arabica que codifica uma proteína de resistência a doenças. O marcador CARF 005 é capaz de diferenciar os cafeeiros analisados em resistentes e susceptíveis a H. vastatrix.

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: ALVARENGA, S. M., CAIXETA, E. T., HUFNAGEL, B., THIEBAUT, F., ZAMBOLIM, E. M., ZAMBOLIM, L., SAKIYAMA, N. S.
Other Authors: SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; BÁRBARA HUFNAGEL, UFV; FLÁVIA THIEBAUT, UFV; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV.
Format: Artigo de periódico biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2011-10-26T11:11:11Z
Subjects:Bioinformática, EST-PCR, Genes de resistência, Mineração de ados., Coffea Arábica, Hemileia Vastatrix.,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/904175
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!