Identificação de um polimorfismo de única base no gene rap-1 de Babesia bovis.

Babesia bovis provoca um grave quadro de anemia hemolítica em bovinos, resultando em grandes prejuízos devido à mortalidade, abortos, redução de fertilidade e queda da produção de carne e leite. O gene RAP-1 (Rhoptry-associated protein)1 de Babesia bovis codifica uma proteína de 60 KDa, que é reconhecida por anticorpos e linfócitos T de bovinos. O objetivo deste trabalho foi verificar a presença de polimorfismos no gene RAP-1 de Babesia bovis amplificado de material proveniente de búfalos infectados. Parte do gene RAP-1 de B. bovis foi amplificado por Nested-PCR. Foram sequenciadas amostras de quatro búfalos e de um bovino para que se pudesse comparar as sequências obtidas nestas espécies. As reações de seqüenciamento foram realizadas utilizando o Kit ABI PRISM® Big Dye terminator v. 3.1 cycle sequencing da Applied Biosystem. Os eletroferogramas gerados pelo seqüenciador ABI 3100 foram submetidos à análise de qualidade pelo programa Phred, que atribui um valor de qualidade a cada nucleotídeo identificado. Em seguida, foram submetidos ao programa de montagem Phrap que agrupa as sequências organizando-as em contigs. A visualização das sequências geradas e, conseqüentemente, dos SNPs foi realizada através do programa Consed. Não foi encontrada diferença entre a sequência de B. bovis isolada de bovino e as dos isolados de búfalos, no entanto, em relação à sequência depositada no banco de dados NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/), foi encontrado um polimorfismo de única base (SNP) G/A no nucleotídeo 688. Verificou-se que este polimorfismo também estava presente na amostra obtida de bovino, pois o segmento do gene RAP-1 do isolado de bovino apresentou genótipo heterozigoto AG . Três isolados de búfalos também apresentaram o genótipo AG para este polimorfismo. O SNP identificado neste trabalho não está depositado no NCBI.

Bibliographic Details

Main Authors:	TIZIOTO, P. C., OBREGON, D., REGITANO, L. C. de A., IBELLI, A. M. G., GIGLIOTI, R., NORDI, E. C. P., OLIVEIRA, M. C. de S.
Other Authors:	UFSCar/SÃO CARLOS, SP; DASIEL OBREGON, UNIVERSIDADE AGRAGRIA DE HAVANA/CUBA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; ADRIANA M. G. IBELLI, UFSCar/SÃO CARLOS, SP; RODRIGO GICLIOTI, UNESP/JABOTICABAL; UNESP/JABOTICABAL; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE.
Format:	Separatas biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2010-11-01
Subjects:	Gene RAP-1, Bovinos, Búfalos., Babesiose, Babesia Bovis, Polimorfismo.,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/865773
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