Variability of the coat protein gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 in Brazil.

Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-l through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence offour GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastem Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NYl) and Chinese (Dawanhong N°2 and SUO) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-l through 4, showed deduced amino acid identities of98-l 00% (Pet-l through 3) and 95% (Pet-4) with North American and Chinese isolates. A total of seventeen amino acid substitutions was detected among the four characterized isolates in comparison to the NYl, Dawanhong NO.2 and SL10 sequences. The results indicated the existence ofnatural variation among GLRaV-3 isolates from grapevines, also demonstrating a lack of correlation between sequence data and geographic origino This variability should be considered when selecting regions ofthe viral genome targeted for reliable and consistent virus molecular detection. AdditionaI keywords: Closteroviridae, Ampelovirus, GLRaV-3. RESUMO Variabilidade do gene da proteína capsidial do Grapevine leafroll-associated vírus 3 no Brasil O enrolamento da folha é uma doença economicamente importante que afeta videiras (Vitis spp.). Nove vírus sorologicamente distintos, Grapevine leafroll-associated virus-l a -9, estão associados à doença. Este estudo descreve a seqüência do gene da proteína capsidial de quatro isolados do GLRa V-3 encontrados no Vale do Rio São Francisco, Nordeste do Brasil. ORNA viral foi extraído de plantas positivas em ELISA para o GLRaV-3 e o gene da proteína capsidial completo foi amplificado por RT-PCR. As seqüências foram geradas automaticamente e comparadas a seqüências completas do gene da proteína capsidial de isolados Norte-Americano (NYl) e Chineses (Dawanhong N°2 e SUO) de GLRaV-3. Os quatro isolados estudados, denominados Pet-l a 4, exibiram identidades de aminoácidos deduzidos de 98-100% (Pet-l a 3) e 95% (Pet-4) com os isolados Norte-Americano e Chineses. Um total de dezessete substituições de aminoácidos foi detectado entre os quatro isolados caracterizados em comparação com as seqüências do NYl, Dawanhong NO.2 e SL1O. Os resultados indicaram a existência de variação natural entre os isolados de GLRaV-3 de videiras, demonstrando também a falta de correlação entre dados de sequência e origem geográfica. Esta variabilidade deve ser considerada quando se selecionam regiões do genoma viral para uma detecção molecular confiável e consistente. Palavras-chave adicionais: Closteroviridae, Ampelovirus, GLRaV-3.

Bibliographic Details

Main Authors:	FAJARDO, T. V. M., DIANESE, E. C., EIRAS, M., CERQUEIRA, D. M., LOPES, D. B., FERREIRA, M. A. S. V., MARTINS, C. R. F.
Other Authors:	THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; Érico C. Dianese, UNB; Marcelo Eiras, Instituto Biológico; Daniela M. Cerqueira, UNB; Daniela B. Lopes, Embrapa Semi-Árido; Marisa A. S. V. Ferreira, UNB; Cláudia R. F. Martins, UNB.
Format:	Artigo de periódico biblioteca
Language:	English eng
Published:	2007-11-08
Subjects:	Enrolamento da folha, Doença de Planta, Genética, Uva, Vírus, Viticultura,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/541980
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