Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora.

A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços na genômica do cafeeiro, como o sequenciamento do genoma de C. canephora, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o chip de genotipagem de DNA para C. canephora (26K Axiom SNP array), visando uma plataforma de genotipagem confiável e de alto rendimento, a ser utilizada nos programas de melhoramento da espécie. A construção do chip foi feita utilizando-se dados gerados a partir do resequenciamento genômico de pools formados por indivíduos dos diferentes grupos de diversidade encontrados na espécie e por indivíduos de C. canephora Conilon, pertencentes aos principais programas de melhoramento no Brasil. Este painel de resequenciamento foi escolhido visando cobrir a maior parte da diversidade genética presente na espécie estudada.

Bibliographic Details

Main Authors:	CARNEIRO, F. de A., MARRACCINI, P., SILVA JUNIOR, O. B. da, GRATTAPAGLIA, D., ANDRADE, A. C.
Other Authors:	Fernanda de Araújo Carneiro, UFLA; Pierre Marraccini, Cirad UMR DAP Montpellier-França; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ALAN CARVALHO ANDRADE, SAPC.
Format:	Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2018-01-09
Subjects:	Genotipagem, SNP array, Melhoramento genético., Coffea canephora, DNA, Gene, Genoma.,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084718
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