Distribuição de retrotansposons do tipo LTR e sequências de DNA ribossômico em cromossomos de genótipos diploides e tetraploides de Arachis spp. por hibridização in situ por fluorescência - FISH.
O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma espécie alotetraploide de origem recente, originado a partir da hibridação entre duas espécies silvestres diplóides, A. duranensis (genoma A) e A.ipaënsis (genoma B), seguida por uma duplicação cromossômica espontânea (3,500-10,000 anos atrás), cujo genoma tem aproximadamente 2,8 Gb de tamanho, composto em sua maioria por sequências repetitivas. A exploração do seu genoma grande e complexo, sem o genoma de referência tem sido um desafio. Portanto, o alotetraploide sintético (A. ipaënsis x A. duranensis)4x, que mimetiza o backgraund genômico do amendoim foi utilizado com objetivo de desvendar os efeitos da hibridação e poliploidização. Esse estudo compreende a primeira caracterização citogenética dos subgenomas desse alotetraploide sintético de Arachis, em comparação com o genótipo natural, o amendoim, estendendo-se para as espécie genitoras. Os alotetraploides, natural e sintético apresentaram semelhanças, como a observada no conteúdo de DNA, com 2C (pg) de 5,71 e 5, 92 respectivamente; na intensidade e posição de bandas centroméricas DAPI+; no número de loci de DNAr 5S e em alguns loci de DNAr 45S com presença de RONs. Foi demonstrado ainda que alguns aspectos da organização e composição dos subgenomas do sintético diferem das observadas nas espécies diplóides, e em menor grau, das observadas em A. hypogaea. Rearranjos de alguns segmentos de DNA nos subgenomas do sintético foram detectados, entre eles a perda dos loci 45S de A. ipaënsis; a inativação da RON no subgenoma B; ausência de bandas evidenciando regiões heterocromáticas CMA+ e diferenças na freqüência e distribuição de RT-LTRs. Portanto a poliploidia realmente vai além da simples união de dois genomas em um mesmo núcleo, podendo envolver também a participação de vastos ajustes moleculares e fisiológicos, que incluem rearranjos genômicos, além do controle epgenético. Algumas das alterações observadas no sintético podem ser semelhantes as que possivelmente ocorreram durante a formação e evolução do amendoim. Esses resultados trazem novos insights sobre a história genômica do amendoim, representando, portanto, uma contribuição significativa para estudos relacionados com o seu contínuo sequenciamento, bem como para a compreensão geral da evolução dos genomas de Arachis.
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Teses biblioteca |
| Language: | pt_BR por |
| Published: |
2017-01-31
|
| Subjects: | Alotetraploide, Citometria de fluxo, CMA, DAPI, DNA ribossômico, GISH, Retrotransposons do tipo LTR., Amendoim, Cromossoma, fish., |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1062278 |
| Tags: |
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