Identificação de loci microssatélitescom potencial de amplificação na espécie de Peixe-Rei (Odontesthes humensis)

Identificação de loci microssatélitescom potencial de amplificação na espécie de Peixe-Rei (Odontesthes humensis)

In this work, 25,806 potentially amplifiable microsatellite loci (PAL) were identified in pejerrey, (Odontesthes humensis), with 21% of dinucleotide, 22% trinucleotide, 37% tetranucleotide, 13% pentanucleotide and 7% hexanucleotide. Of the total loci, 167 were classified as "Best PAL", more likely to be variables in populations. The results show that with a small coverage of the genome it was possible to identify a large number of microsatellite loci.

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Main Authors: Tavares,R.A., Piedras,S.R.N., Nunes,M.D., Almeida,D.B., Moreira,C.G.A., Fernandes,J.M., Freitas,S.F., Moreira,H.L.M., Pouey,J.L.O.F., Dionello,N.J.L.
Format: Digital revista
Language:Portuguese
Published: Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária 2014
Online Access:http://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000601941
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spelling oai:scielo:S0102-093520140006019412015-10-27Identificação de loci microssatélitescom potencial de amplificação na espécie de Peixe-Rei (Odontesthes humensis)Tavares,R.A.Piedras,S.R.N.Nunes,M.D.Almeida,D.B.Moreira,C.G.A.Fernandes,J.M.Freitas,S.F.Moreira,H.L.M.Pouey,J.L.O.F.Dionello,N.J.L. peixe-rei microssatélites marcadores moleculares PAL In this work, 25,806 potentially amplifiable microsatellite loci (PAL) were identified in pejerrey, (Odontesthes humensis), with 21% of dinucleotide, 22% trinucleotide, 37% tetranucleotide, 13% pentanucleotide and 7% hexanucleotide. Of the total loci, 167 were classified as "Best PAL", more likely to be variables in populations. The results show that with a small coverage of the genome it was possible to identify a large number of microsatellite loci.info:eu-repo/semantics/openAccessUniversidade Federal de Minas Gerais, Escola de VeterináriaArquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia v.66 n.6 20142014-12-01info:eu-repo/semantics/articletext/htmlhttp://old.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000601941pt10.1590/1678-7444
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