Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (SPAR) Puno. Realizar la genotipificación y selección de marcadores STR útiles para la asignación de paternidad y parentesco. Metodología: Se evaluaron 10 marcadores STR a partir de ADN aislado de sangre y de folículos pilosos de 183 individuos colectados al azar procedentes de dos rebaños. Resultados y Conclusiones: Se observó un alto nivel de variabilidad alélica en el total de individuos analizados, y la presencia de alelos exclusivos entre poblaciones, con frecuencias menores al 1,5% en los loci LCA37, LCA90, LCA5, VOLP92, YWLL36, YWLL44 y YWLL08. Se propone la incorporación de tres marcadores adicionales, VOLP92, LCA94 y LCA90 para los análisis de variabilidad genética en alpacas. Los valores de FIS (0,016), y FST (0,003) reflejaron bajo niveles de endogamia. El rebaño del Fundo Itita presentó una mayor Ho (0,858) respecto a la He (0,848), mientras que por el contrario el rebaño del Centro Munay Paqocha presentó un menor valor de la Ho (0,815) respecto a la He (0,848), con una tendencia al déficit de heterocigotos. Los 10 marcadores presentaron una probabilidad de exclusión de parentesco adecuada, con un valor superior al 99,9%, cuando se conoce el genotipo de ambos padres, y un poder de discriminación mayor a 0,90. Además, se alcanzó un valor PEC de 0,999 considerando solo los marcadores YWLL08, YWLL44, LCA37, YWLL36, LCA8; siendo YWLL08 el de mayor valor (0,885). La prueba de filiación permitió detectar mayores errores de asignación de maternidad (13,04%) y paternidad (30,4%) en el rebaño del Fundo Itita, en comparación a Munay Paqocha con errores de designación de maternidad de 7,69% y de paternidad de 17,95%, concluyendo que este centro posee un mejor registro de empadres.
Main Authors: | , , |
---|---|
Format: | info:eu-repo/semantics/article biblioteca |
Language: | spa |
Published: |
Universidad Peruana Cayetano Heredia
|
Subjects: | Camélidos sudamericanos, Heterocigosidad, Coeficiente de endogamia, Probabilidad de exclusión, STR, https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02, |
Online Access: | https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
id |
dig-inia-pe-20.500.12955-1855 |
---|---|
record_format |
koha |
spelling |
dig-inia-pe-20.500.12955-18552022-11-21T19:57:12Z Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) Genetic variability of Peruvian Alpacas (Vicugna pacos) by using microsatellite markers Yalta Macedo, Claudia Esther Sotil, Giovanna Veli Rivera, Eudosio A. Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (SPAR) Puno. Realizar la genotipificación y selección de marcadores STR útiles para la asignación de paternidad y parentesco. Metodología: Se evaluaron 10 marcadores STR a partir de ADN aislado de sangre y de folículos pilosos de 183 individuos colectados al azar procedentes de dos rebaños. Resultados y Conclusiones: Se observó un alto nivel de variabilidad alélica en el total de individuos analizados, y la presencia de alelos exclusivos entre poblaciones, con frecuencias menores al 1,5% en los loci LCA37, LCA90, LCA5, VOLP92, YWLL36, YWLL44 y YWLL08. Se propone la incorporación de tres marcadores adicionales, VOLP92, LCA94 y LCA90 para los análisis de variabilidad genética en alpacas. Los valores de FIS (0,016), y FST (0,003) reflejaron bajo niveles de endogamia. El rebaño del Fundo Itita presentó una mayor Ho (0,858) respecto a la He (0,848), mientras que por el contrario el rebaño del Centro Munay Paqocha presentó un menor valor de la Ho (0,815) respecto a la He (0,848), con una tendencia al déficit de heterocigotos. Los 10 marcadores presentaron una probabilidad de exclusión de parentesco adecuada, con un valor superior al 99,9%, cuando se conoce el genotipo de ambos padres, y un poder de discriminación mayor a 0,90. Además, se alcanzó un valor PEC de 0,999 considerando solo los marcadores YWLL08, YWLL44, LCA37, YWLL36, LCA8; siendo YWLL08 el de mayor valor (0,885). La prueba de filiación permitió detectar mayores errores de asignación de maternidad (13,04%) y paternidad (30,4%) en el rebaño del Fundo Itita, en comparación a Munay Paqocha con errores de designación de maternidad de 7,69% y de paternidad de 17,95%, concluyendo que este centro posee un mejor registro de empadres. 2015-02-16 info:eu-repo/semantics/article https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855 spa https://doi.org/10.20453/stv.v2i2.2253 info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ application/pdf Universidad Peruana Cayetano Heredia Instituto Nacional de Innovación Agraria Repositorio Institucional - INIA |
institution |
INIA PE |
collection |
DSpace |
country |
Perú |
countrycode |
PE |
component |
Bibliográfico |
access |
En linea |
databasecode |
dig-inia-pe |
tag |
biblioteca |
region |
America del Sur |
libraryname |
Biblioteca del INIA Perú |
language |
spa |
topic |
Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 |
spellingShingle |
Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 Yalta Macedo, Claudia Esther Sotil, Giovanna Veli Rivera, Eudosio A. Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
description |
Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (SPAR) Puno. Realizar la genotipificación y selección de marcadores STR útiles para la asignación de paternidad y parentesco. Metodología: Se evaluaron 10 marcadores STR a partir de ADN aislado de sangre y de folículos pilosos de 183 individuos colectados al azar procedentes de dos rebaños. Resultados y Conclusiones: Se observó un alto nivel de variabilidad alélica en el total de individuos analizados, y la presencia de alelos exclusivos entre poblaciones, con frecuencias menores al 1,5% en los loci LCA37, LCA90, LCA5, VOLP92, YWLL36, YWLL44 y YWLL08. Se propone la incorporación de tres marcadores adicionales, VOLP92, LCA94 y LCA90 para los análisis de variabilidad genética en alpacas. Los valores de FIS (0,016), y FST (0,003) reflejaron bajo niveles de endogamia. El rebaño del Fundo Itita presentó una mayor Ho (0,858) respecto a la He (0,848), mientras que por el contrario el rebaño del Centro Munay Paqocha presentó un menor valor de la Ho (0,815) respecto a la He (0,848), con una tendencia al déficit de heterocigotos. Los 10 marcadores presentaron una probabilidad de exclusión de parentesco adecuada, con un valor superior al 99,9%, cuando se conoce el genotipo de ambos padres, y un poder de discriminación mayor a 0,90. Además, se alcanzó un valor PEC de 0,999 considerando solo los marcadores YWLL08, YWLL44, LCA37, YWLL36, LCA8; siendo YWLL08 el de mayor valor (0,885). La prueba de filiación permitió detectar mayores errores de asignación de maternidad (13,04%) y paternidad (30,4%) en el rebaño del Fundo Itita, en comparación a Munay Paqocha con errores de designación de maternidad de 7,69% y de paternidad de 17,95%, concluyendo que este centro posee un mejor registro de empadres. |
format |
info:eu-repo/semantics/article |
topic_facet |
Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 |
author |
Yalta Macedo, Claudia Esther Sotil, Giovanna Veli Rivera, Eudosio A. |
author_facet |
Yalta Macedo, Claudia Esther Sotil, Giovanna Veli Rivera, Eudosio A. |
author_sort |
Yalta Macedo, Claudia Esther |
title |
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
title_short |
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
title_full |
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
title_fullStr |
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
title_full_unstemmed |
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) |
title_sort |
variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas huacaya (vicugna pacos) |
publisher |
Universidad Peruana Cayetano Heredia |
url |
https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855 |
work_keys_str_mv |
AT yaltamacedoclaudiaesther variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos AT sotilgiovanna variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos AT veliriveraeudosioa variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos AT yaltamacedoclaudiaesther geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers AT sotilgiovanna geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers AT veliriveraeudosioa geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers |
_version_ |
1756091302715326464 |