Problèmes de modélisation dus aux petits effectifs dans l'analyse de la distribution des parasites agrégatifs

Dans le domaine de la défense des cultures, il se pose souvent la question de la sélection des variétés peu sensibles aux attaques des champignons, des bactéries ou des virus. Une étude de la distribution de la population parasite dans la population hôte permettrait de prendre conscience de l'inégalité devant le parasitisme et de comprendre ses conséquences sur le comportement de la plante. Pour arriver à une modélisation du système plante-parasite, on définit des unités expérimentales identiques sur les plantes hôtes et l'on effectue le comptage des parasites, des lésions dues à des maladies, des trous sur une feuille. Les comptages originaux peuvent être résumés par une distribution des fréquences organisées. Trois cas peuvent être considérés dans le processus de modélisation selon l'hypothèse émise : répulsion entre les parasites, colonisation de la plante par les parasites de façon indépendante les unes des autres ou attraction entre les parasites. Ce dernier cas est une distribution binomiale négative qui se caractérise par une stabilité si le degré d'aggrégativité est grand. Ce comportement est souvent développé par les parasites. Il est possible de le modéliser à l'aide des logiciels comme SAS, GLIM ou GENSTAT. Il faut noter, cependant, la difficulté rencontrée dans l'évaluation de l'inférence par le modèle linéaire généralisé

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Main Author: Kizungu, Roger Vumilia
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Published: CIRAD
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Kizungu, Roger Vumilia
Problèmes de modélisation dus aux petits effectifs dans l'analyse de la distribution des parasites agrégatifs
description Dans le domaine de la défense des cultures, il se pose souvent la question de la sélection des variétés peu sensibles aux attaques des champignons, des bactéries ou des virus. Une étude de la distribution de la population parasite dans la population hôte permettrait de prendre conscience de l'inégalité devant le parasitisme et de comprendre ses conséquences sur le comportement de la plante. Pour arriver à une modélisation du système plante-parasite, on définit des unités expérimentales identiques sur les plantes hôtes et l'on effectue le comptage des parasites, des lésions dues à des maladies, des trous sur une feuille. Les comptages originaux peuvent être résumés par une distribution des fréquences organisées. Trois cas peuvent être considérés dans le processus de modélisation selon l'hypothèse émise : répulsion entre les parasites, colonisation de la plante par les parasites de façon indépendante les unes des autres ou attraction entre les parasites. Ce dernier cas est une distribution binomiale négative qui se caractérise par une stabilité si le degré d'aggrégativité est grand. Ce comportement est souvent développé par les parasites. Il est possible de le modéliser à l'aide des logiciels comme SAS, GLIM ou GENSTAT. Il faut noter, cependant, la difficulté rencontrée dans l'évaluation de l'inférence par le modèle linéaire généralisé
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