Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória.

O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical‑by‑descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo, quando não. A comparação entre os modelos foi feita nas posições dos marcadores (seis marcadores microssatélites) e nas intermediárias, entre os marcadores. O MRA detectou QTL significativo na posição 65 cM do cromossomo 7 e, portanto, foi mais eficiente que a metodologia tradicional, que não detectou QTL significativo em nenhum dos fenótipos avaliados. A metodologia proposta possibilitou a detecção de QTL com efeito sobre toda a trajetória de crescimento, dentro da amplitude de idade considerada (do nascimento aos 150 dias).

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Main Authors: PINHEIRO, V. R., SILVA, F. F. e, GUIMARÃES, S. E. F., RESENDE, M. D. V. de, LOPES, P. S., CRUZ, C. D., AZEVEDO, C. F.
Other Authors: MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF.
Format: Artigo de periódico biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2013-09-18
Subjects:Dados longitudinais, Identical-by-descent, Locos de característica quantitativas, Seleção assistida por marcadores., Curva de Crescimento., Sus scrofa.,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/966562
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spelling dig-alice-doc-9665622017-08-16T01:59:35Z Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. PINHEIRO, V. R. SILVA, F. F. e GUIMARÃES, S. E. F. RESENDE, M. D. V. de LOPES, P. S. CRUZ, C. D. AZEVEDO, C. F. MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. Dados longitudinais Identical-by-descent Locos de característica quantitativas Seleção assistida por marcadores. Curva de Crescimento. Sus scrofa. O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical‑by‑descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo, quando não. A comparação entre os modelos foi feita nas posições dos marcadores (seis marcadores microssatélites) e nas intermediárias, entre os marcadores. O MRA detectou QTL significativo na posição 65 cM do cromossomo 7 e, portanto, foi mais eficiente que a metodologia tradicional, que não detectou QTL significativo em nenhum dos fenótipos avaliados. A metodologia proposta possibilitou a detecção de QTL com efeito sobre toda a trajetória de crescimento, dentro da amplitude de idade considerada (do nascimento aos 150 dias). 2014-03-19T23:24:52Z 2014-03-19T23:24:52Z 2013-09-18 2013 2014-03-19T23:24:52Z Artigo de periódico Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 190-196, fev. 2013. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/966562 pt_BR por openAccess
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