Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de gentipagem de SNPs com chips de alta densidade.
O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da plataforma Illumina. Foram utilizados dados de 400 animais (bovinos Canchim), participantes de um programa de melhoramento da Embrapa Pecuária Sudeste, genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina).
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Published: |
2013-03-28
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Subjects: | Genotipagem de bovinos, Polimorfismo de base única, Chips de SNP, Single nucleotide polymorphism, |
Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/954567 |
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dig-alice-doc-9545672017-08-15T22:37:21Z Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de gentipagem de SNPs com chips de alta densidade. GONÇALVES, A. R. GIACHETTO, P. F. ANDRÉ ROBLES GONÇALVES, PUC-Campinas; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA. Genotipagem de bovinos Polimorfismo de base única Chips de SNP Single nucleotide polymorphism O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da plataforma Illumina. Foram utilizados dados de 400 animais (bovinos Canchim), participantes de um programa de melhoramento da Embrapa Pecuária Sudeste, genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina). 2013-04-01T23:36:56Z 2013-04-01T23:36:56Z 2013-03-28 2012 2020-01-22T11:11:11Z Anais e Proceedings de eventos In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/954567 pt_BR por openAccess p. 183-186. |
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O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da plataforma Illumina. Foram utilizados dados de 400 animais (bovinos Canchim), participantes de um programa de melhoramento da Embrapa Pecuária Sudeste, genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina). |
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