Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores.
A seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos.
| Main Authors: | , , , , , , |
|---|---|
| Other Authors: | |
| Format: | Artigo em anais e proceedings biblioteca |
| Language: | por |
| Published: |
2009-02-27
|
| Subjects: | Bovinos, Seleção genômica, SNP, Marcador Genético, |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/596763 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Summary: | A seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos. |
|---|