Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.

O nematóide formador de galhas Meloidogyne incognita ("southem root-knot nematode", SRN) apresenta distribuição mundial, causando grandes perdas em várias culturas. Seu ciclo de vida compreende seis estádios de desenvolvimento (ovo, larva 1-4 e adulto). A larva L2, fase infectiva, penetra na raiz de planta hospedeira por força mecânica e degradação enzimática para, então, estabelecer a interação planta-patógeno. Em condições favoráveis, as larvas L2 se diferenciam em f'emeas adultas apomíticas, que completam o ciclo de vida após a deposição de mais de 2000 ovos. As práticas agrícolas atuais não são eficientes contra os fitonematóides, de modo que uma estratégia poderosa e promissora para o controle de nematóides é a produção de plantas transgênicas expressando moléculas que afetam o parasitismo. Proteinases são importantes alvos para o controle de nematóides e o primeiro capítulo descreve um estudo das ESTs codificadoras de aspártico, serino e cisteíno proteinases disponíveis em banco de dados, além da completa caracterização de cDNAs isolados anteriormente. Parece existir um abundância de ESTs de aspártico proteinases em fase larval, quando comparado com ovos e fêmeas. Apenas em bibliotecas de ovos se encontram ESTs de serino proteinase. Por outro lado, ESTs de cisteíno proteinase são as mais abundantes e são encontradas em todas as fases. O cDNA Mi-aspl codifica uma catepsina D-tipo com vários ortólogos conhecidos em nematóides. Análises de expressão temporal e espacial mostram que Mi-aspl seja mais transcrito em ovos, do que larvas L2 ou fêmeas, sugerindo um importante papel na embriogênese do nematóide. Já no segundo capítulo, objetivando a identificação de genes envolvidos na infecção e nos processos vitais, uma biblioteca de cDNAs foi construí da a partir de rnRNA de larvas L2, usando o "Superscript Plasmid System with Gateway Technology for cDNA Synthesis and Cloning" (Invitrogen). A biblioteca de ESTs apresentou 2.137 seqüências validadas com 17% de redundância, distribuídas em 1.506 singlets e 197 contigs, gerados de 631 ESTs. A anotação gênica foi obtida por comparação dos resultados do BLASTx (GenBank). A análise in si/ico das seqüências obtidas foi feita para predição funcional, agrupamento filogenético, predição de transferência horizontal gênica e determinação da importância na interação planta-patógeno. A predição da função gênica por classificação em categorias KOG demonstrou que várias seqüências são relacionadas com mecanismos de transdução de sinais (13%) e modificações pós-traducionais, renovação de proteínas, chaperonas (12%). Os trabalhos de validação de genes-alvo estão em andamento e incluem ensaios in vitro, in vivo e in planta.

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: FRAGOSO, R. da R.
Format: Teses biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2006-11-17
Subjects:Identificação molecular, Caracterização molecular, Genes codificadores de proteínas, Plantas transgênicas, Resistência a fitonematóides., Meloidogyne Incognita, Parasitismo.,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188037
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id dig-alice-doc-188037
record_format koha
spelling dig-alice-doc-1880372018-04-04T00:37:17Z Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga. FRAGOSO, R. da R. Identificação molecular Caracterização molecular Genes codificadores de proteínas Plantas transgênicas Resistência a fitonematóides. Meloidogyne Incognita Parasitismo. O nematóide formador de galhas Meloidogyne incognita ("southem root-knot nematode", SRN) apresenta distribuição mundial, causando grandes perdas em várias culturas. Seu ciclo de vida compreende seis estádios de desenvolvimento (ovo, larva 1-4 e adulto). A larva L2, fase infectiva, penetra na raiz de planta hospedeira por força mecânica e degradação enzimática para, então, estabelecer a interação planta-patógeno. Em condições favoráveis, as larvas L2 se diferenciam em f'emeas adultas apomíticas, que completam o ciclo de vida após a deposição de mais de 2000 ovos. As práticas agrícolas atuais não são eficientes contra os fitonematóides, de modo que uma estratégia poderosa e promissora para o controle de nematóides é a produção de plantas transgênicas expressando moléculas que afetam o parasitismo. Proteinases são importantes alvos para o controle de nematóides e o primeiro capítulo descreve um estudo das ESTs codificadoras de aspártico, serino e cisteíno proteinases disponíveis em banco de dados, além da completa caracterização de cDNAs isolados anteriormente. Parece existir um abundância de ESTs de aspártico proteinases em fase larval, quando comparado com ovos e fêmeas. Apenas em bibliotecas de ovos se encontram ESTs de serino proteinase. Por outro lado, ESTs de cisteíno proteinase são as mais abundantes e são encontradas em todas as fases. O cDNA Mi-aspl codifica uma catepsina D-tipo com vários ortólogos conhecidos em nematóides. Análises de expressão temporal e espacial mostram que Mi-aspl seja mais transcrito em ovos, do que larvas L2 ou fêmeas, sugerindo um importante papel na embriogênese do nematóide. Já no segundo capítulo, objetivando a identificação de genes envolvidos na infecção e nos processos vitais, uma biblioteca de cDNAs foi construí da a partir de rnRNA de larvas L2, usando o "Superscript Plasmid System with Gateway Technology for cDNA Synthesis and Cloning" (Invitrogen). A biblioteca de ESTs apresentou 2.137 seqüências validadas com 17% de redundância, distribuídas em 1.506 singlets e 197 contigs, gerados de 631 ESTs. A anotação gênica foi obtida por comparação dos resultados do BLASTx (GenBank). A análise in si/ico das seqüências obtidas foi feita para predição funcional, agrupamento filogenético, predição de transferência horizontal gênica e determinação da importância na interação planta-patógeno. A predição da função gênica por classificação em categorias KOG demonstrou que várias seqüências são relacionadas com mecanismos de transdução de sinais (13%) e modificações pós-traducionais, renovação de proteínas, chaperonas (12%). Os trabalhos de validação de genes-alvo estão em andamento e incluem ensaios in vitro, in vivo e in planta. Tese (Doutorado em Biologia Molecular) - Instituto de Ciências Biológicas, Universidade de Brasília, Brasília. Orientadora: Maria Fátima Grossi de Sá. 2018-04-04T00:37:11Z 2018-04-04T00:37:11Z 2006-11-17 2006 2018-04-04T00:37:11Z Teses 2006 http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188037 pt_BR por openAccess 94 f.
institution EMBRAPA
collection DSpace
country Brasil
countrycode BR
component Bibliográfico
access En linea
databasecode dig-alice
tag biblioteca
region America del Sur
libraryname Sistema de bibliotecas de EMBRAPA
language pt_BR
por
topic Identificação molecular
Caracterização molecular
Genes codificadores de proteínas
Plantas transgênicas
Resistência a fitonematóides.
Meloidogyne Incognita
Parasitismo.
Identificação molecular
Caracterização molecular
Genes codificadores de proteínas
Plantas transgênicas
Resistência a fitonematóides.
Meloidogyne Incognita
Parasitismo.
spellingShingle Identificação molecular
Caracterização molecular
Genes codificadores de proteínas
Plantas transgênicas
Resistência a fitonematóides.
Meloidogyne Incognita
Parasitismo.
Identificação molecular
Caracterização molecular
Genes codificadores de proteínas
Plantas transgênicas
Resistência a fitonematóides.
Meloidogyne Incognita
Parasitismo.
FRAGOSO, R. da R.
Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
description O nematóide formador de galhas Meloidogyne incognita ("southem root-knot nematode", SRN) apresenta distribuição mundial, causando grandes perdas em várias culturas. Seu ciclo de vida compreende seis estádios de desenvolvimento (ovo, larva 1-4 e adulto). A larva L2, fase infectiva, penetra na raiz de planta hospedeira por força mecânica e degradação enzimática para, então, estabelecer a interação planta-patógeno. Em condições favoráveis, as larvas L2 se diferenciam em f'emeas adultas apomíticas, que completam o ciclo de vida após a deposição de mais de 2000 ovos. As práticas agrícolas atuais não são eficientes contra os fitonematóides, de modo que uma estratégia poderosa e promissora para o controle de nematóides é a produção de plantas transgênicas expressando moléculas que afetam o parasitismo. Proteinases são importantes alvos para o controle de nematóides e o primeiro capítulo descreve um estudo das ESTs codificadoras de aspártico, serino e cisteíno proteinases disponíveis em banco de dados, além da completa caracterização de cDNAs isolados anteriormente. Parece existir um abundância de ESTs de aspártico proteinases em fase larval, quando comparado com ovos e fêmeas. Apenas em bibliotecas de ovos se encontram ESTs de serino proteinase. Por outro lado, ESTs de cisteíno proteinase são as mais abundantes e são encontradas em todas as fases. O cDNA Mi-aspl codifica uma catepsina D-tipo com vários ortólogos conhecidos em nematóides. Análises de expressão temporal e espacial mostram que Mi-aspl seja mais transcrito em ovos, do que larvas L2 ou fêmeas, sugerindo um importante papel na embriogênese do nematóide. Já no segundo capítulo, objetivando a identificação de genes envolvidos na infecção e nos processos vitais, uma biblioteca de cDNAs foi construí da a partir de rnRNA de larvas L2, usando o "Superscript Plasmid System with Gateway Technology for cDNA Synthesis and Cloning" (Invitrogen). A biblioteca de ESTs apresentou 2.137 seqüências validadas com 17% de redundância, distribuídas em 1.506 singlets e 197 contigs, gerados de 631 ESTs. A anotação gênica foi obtida por comparação dos resultados do BLASTx (GenBank). A análise in si/ico das seqüências obtidas foi feita para predição funcional, agrupamento filogenético, predição de transferência horizontal gênica e determinação da importância na interação planta-patógeno. A predição da função gênica por classificação em categorias KOG demonstrou que várias seqüências são relacionadas com mecanismos de transdução de sinais (13%) e modificações pós-traducionais, renovação de proteínas, chaperonas (12%). Os trabalhos de validação de genes-alvo estão em andamento e incluem ensaios in vitro, in vivo e in planta.
format Teses
topic_facet Identificação molecular
Caracterização molecular
Genes codificadores de proteínas
Plantas transgênicas
Resistência a fitonematóides.
Meloidogyne Incognita
Parasitismo.
author FRAGOSO, R. da R.
author_facet FRAGOSO, R. da R.
author_sort FRAGOSO, R. da R.
title Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
title_short Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
title_full Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
title_fullStr Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
title_full_unstemmed Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
title_sort prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga.
publishDate 2006-11-17
url http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188037
work_keys_str_mv AT fragosordar prospeccaodemoleculasalvoparaintervencaodainteracaoplantapraga
_version_ 1756024520341192704