Genes diferencialmente expressos no transcriptoma de suínos normais e afetados com hérnia escrotal.

Resumo: A incidência de hérnias escrotais em suínos é preocupante para a indústria suinícola devido a perdas econômicas significativas e ao impacto negativo no bem-estar animal. As vias metabólicas e os genes envolvidos nessa patologia permanecem pouco conhecidos. Na tentativa de esclarecer os mecanismos genéticos envolvidos na ocorrência da hérnia escrotal em suínos, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos entre suínos normais e afetados por essa anomalia, por meio da tecnologia de RNA-Seq. Foram utilizados 8 suínos da raça Landrace (4 normais e 4 com hérnia escrotal). O sequenciamento do mRNA foi realizado em equipamento HiSeq 2500 da Illumina. Os genes diferencialmente expressos foram obtidos utilizando-se o pacote EdgeR, com base no False Discovery Rate (FDR≤ 0,05). Um total de 13.035 genes foi expresso no tecido herniário e não herniário dos suínos, dos quais 644 foram diferencialmente expressos entre os suínos normais e afetados. Após a análise de ontologia gênica (GO), alguns genes candidatos foram prospectados. O conhecimento dos genes que controlam esse distúrbio pode apoiar estratégias de melhoramento para a redução dessa anomalia na produção de suínos. Abstract: The incidence of scrotal hernias in pigs is a concern to the pig industry due to the significant economic losses and the negative impact on welfare. The genetic pathways and genes involved in this pathology remain unknown. To better understand the genetic mechanisms involved in the occurrence of scrotal hernia in pigs, the aim of this study was to identify differentially expressed genes between normal and affected pigs with this anomaly, using RNA-Seq technology. In this study, Landrace pigs were used (4 normal and 4 with scrotal hernia). Sequencing of mRNA was performed in the Illumina HiSeq 2500 equipment. Differentially expressed genes were obtained using the EdgeR package, based on the False Discovery Rate (FDR≤0.05). A total of 13,035 genes were found to be expressed in the hernial and nonhernial tissue. From those, 644 differentially expressed genes were identified between normal and affected pigs. After gene ontology analyses, some candidate genes were prospected. The knowledge of the genes that control this disorder could support breeding strategies for reducing this anomaly in the pig production.

Bibliographic Details

Main Authors:	ROMANO, G. de S., IBELLI, A. M. G., PEIXOTO, J. de O., CANTAO, M. E., WEBER, T., MORES, M. A. Z., MORES, N., PEDROSA, V. B., PINTO, L. F. B., COUTINHO, L. L., LEDUR, M. C.
Other Authors:	GABRIELI DE SOUZA ROMANO, UFBA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; TOMÁS WEBER, BRF/Curitiba; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; NELSON MORES, CNPSA; VICTOR BRENO PEDROSA, UEPG; LUIS FERNANDO BATISTA PINTO, UFBA; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA.
Format:	Separatas biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2017-10-20
Subjects:	Melhoramento genético animal, Suíno, Polimorfismo, Distúrbio fisiológico, Hérnia,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077743
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