Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente
Resumen Introducción: La cuantificación de SARS-CoV-2 en aguas residuales es una herramienta que permite determinar la tendencia de la circulación viral en un área geográfica determinada. Objetivo: Cuantificar el virus SARS-CoV-2 en 15 plantas de tratamiento de aguas residuales en diferentes ciudades de Chile para establecer una comparación con las variables de: i) casos activos por cada 100.000 habs.; ii) positividad diaria (casos nuevos); y iii) fases del plan de confinamiento. Metodología: SARS-CoV-2 se concentró a partir de muestras de aguas residuales. Para obtener el número de genomas del virus por litro se realizó una cuantificación absoluta utilizando qRT-PCR. Resultados: Entre enero y junio de 2021 se procesaron 253 muestras, siendo todas positivas para la presencia del virus. Asimismo, se logró determinar que la tasa de casos activos por cada 100.000 habs. es la variable que mejor se ajusta a las tendencias obtenidas con la cuantificación de la carga viral en las aguas residuales. Conclusiones: La cuantificación de SARS-CoV-2 en las aguas residuales de manera permanente es una herramienta eficiente para determinar la tendencia del virus en un área geográfica determinada y, en conjunto con una vigilancia genómica, puede constituirse en una vigilancia centinela ideal generando alertas sobre futuros brotes.
Main Authors: | , , , , , , , |
---|---|
Format: | Digital revista |
Language: | Spanish / Castilian |
Published: |
Sociedad Chilena de Infectología
2022
|
Online Access: | http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-10182022000600690 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
id |
oai:scielo:S0716-10182022000600690 |
---|---|
record_format |
ojs |
spelling |
oai:scielo:S0716-101820220006006902023-04-16Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanenteOlivares-Pacheco,JorgeAdell,Aiko D.Hepp,Matías I.Reis,Andressa S.Echeverría,CésarIbacache-Quiroga,ClaudiaAssmann,PaulinaGaggero,Aldo SARS-CoV-2 epidemiología basada en aguas residuales (EBAR) tasa de casos activos vigilancia genómica vigilancia centinela Resumen Introducción: La cuantificación de SARS-CoV-2 en aguas residuales es una herramienta que permite determinar la tendencia de la circulación viral en un área geográfica determinada. Objetivo: Cuantificar el virus SARS-CoV-2 en 15 plantas de tratamiento de aguas residuales en diferentes ciudades de Chile para establecer una comparación con las variables de: i) casos activos por cada 100.000 habs.; ii) positividad diaria (casos nuevos); y iii) fases del plan de confinamiento. Metodología: SARS-CoV-2 se concentró a partir de muestras de aguas residuales. Para obtener el número de genomas del virus por litro se realizó una cuantificación absoluta utilizando qRT-PCR. Resultados: Entre enero y junio de 2021 se procesaron 253 muestras, siendo todas positivas para la presencia del virus. Asimismo, se logró determinar que la tasa de casos activos por cada 100.000 habs. es la variable que mejor se ajusta a las tendencias obtenidas con la cuantificación de la carga viral en las aguas residuales. Conclusiones: La cuantificación de SARS-CoV-2 en las aguas residuales de manera permanente es una herramienta eficiente para determinar la tendencia del virus en un área geográfica determinada y, en conjunto con una vigilancia genómica, puede constituirse en una vigilancia centinela ideal generando alertas sobre futuros brotes.info:eu-repo/semantics/openAccessSociedad Chilena de InfectologíaRevista chilena de infectología v.39 n.6 20222022-12-01text/htmlhttp://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-10182022000600690es10.4067/S0716-10182022000600690 |
institution |
SCIELO |
collection |
OJS |
country |
Chile |
countrycode |
CL |
component |
Revista |
access |
En linea |
databasecode |
rev-scielo-cl |
tag |
revista |
region |
America del Sur |
libraryname |
SciELO |
language |
Spanish / Castilian |
format |
Digital |
author |
Olivares-Pacheco,Jorge Adell,Aiko D. Hepp,Matías I. Reis,Andressa S. Echeverría,César Ibacache-Quiroga,Claudia Assmann,Paulina Gaggero,Aldo |
spellingShingle |
Olivares-Pacheco,Jorge Adell,Aiko D. Hepp,Matías I. Reis,Andressa S. Echeverría,César Ibacache-Quiroga,Claudia Assmann,Paulina Gaggero,Aldo Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
author_facet |
Olivares-Pacheco,Jorge Adell,Aiko D. Hepp,Matías I. Reis,Andressa S. Echeverría,César Ibacache-Quiroga,Claudia Assmann,Paulina Gaggero,Aldo |
author_sort |
Olivares-Pacheco,Jorge |
title |
Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
title_short |
Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
title_full |
Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
title_fullStr |
Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
title_full_unstemmed |
Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
title_sort |
detección y cuantificación de sars-cov-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente |
description |
Resumen Introducción: La cuantificación de SARS-CoV-2 en aguas residuales es una herramienta que permite determinar la tendencia de la circulación viral en un área geográfica determinada. Objetivo: Cuantificar el virus SARS-CoV-2 en 15 plantas de tratamiento de aguas residuales en diferentes ciudades de Chile para establecer una comparación con las variables de: i) casos activos por cada 100.000 habs.; ii) positividad diaria (casos nuevos); y iii) fases del plan de confinamiento. Metodología: SARS-CoV-2 se concentró a partir de muestras de aguas residuales. Para obtener el número de genomas del virus por litro se realizó una cuantificación absoluta utilizando qRT-PCR. Resultados: Entre enero y junio de 2021 se procesaron 253 muestras, siendo todas positivas para la presencia del virus. Asimismo, se logró determinar que la tasa de casos activos por cada 100.000 habs. es la variable que mejor se ajusta a las tendencias obtenidas con la cuantificación de la carga viral en las aguas residuales. Conclusiones: La cuantificación de SARS-CoV-2 en las aguas residuales de manera permanente es una herramienta eficiente para determinar la tendencia del virus en un área geográfica determinada y, en conjunto con una vigilancia genómica, puede constituirse en una vigilancia centinela ideal generando alertas sobre futuros brotes. |
publisher |
Sociedad Chilena de Infectología |
publishDate |
2022 |
url |
http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-10182022000600690 |
work_keys_str_mv |
AT olivarespachecojorge deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT adellaikod deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT heppmatiasi deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT reisandressas deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT echeverriacesar deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT ibacachequirogaclaudia deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT assmannpaulina deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente AT gaggeroaldo deteccionycuantificaciondesarscov2enplantasdetratamientodeaguasresidualesdediferentesciudadesdechilehacialaimplementaciondeunavigilanciacentinelapermanente |
_version_ |
1764986343414300672 |