Implementación de marcadores genéticos ISSR en sotol (Dasylirion cedrosanum)
"El presente trabajo se realizó con el objetivo de implementar en sotol (D. cedrosanum) un tipo de marcador anónimo: los ISSRs, así como la evaluación de estos marcadores en términos de la capacidad para detectar polimorfismo genético en poblaciones. Se usó material genético (DNA) de 14 hembras y 14 machos, las cuales fueron probados con cuatro iniciadores de marcadores ISSR: BEC, DAT, W814 y W844. La prueba se realizó mediante el uso de la PCR y electroforesis. Se analizaron los patrones electroforéticos y por cada iniciador se construyó una matriz binaria donde 0 es ausencia de banda, 1 es presencia de banda y NA es dato perdido. A partir de los resultados obtenidos se estimaron dos parámetros: entropía de Shannon e índice de Gini-Simpson, adecuados para detectar diversidad entre genotipos. Los análisis estadísticos fueron realizados en el ambiente y lenguaje de cómputo R. Los resultados estadísticos arrojaron datos que muestran al marcador ISSR DAT como posiblemente el mejor para estudios de diversidad genética en D. cedrosanum, seguido de los marcadores ISSR W814 e ISSR W844. El marcador ISSR BEC mostró un valor global de entropía muy bajo, lo cual puede ser una limitate en estudios de diversidad en poblaciones de sotol"
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Other Authors: | |
Format: | Tesis de licenciatura biblioteca |
Language: | Español |
Subjects: | Sotol, Diversidad genética - Marcadores moleculares, CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA, |
Online Access: | http://repositorio.uaaan.mx:8080/xmlui/handle/123456789/1562 |
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Summary: | "El presente trabajo se realizó con el objetivo de implementar en sotol (D. cedrosanum) un tipo de marcador anónimo: los ISSRs, así como la evaluación de estos marcadores en términos de la capacidad para detectar polimorfismo genético en poblaciones. Se usó material genético (DNA) de 14 hembras y 14 machos, las cuales fueron probados con cuatro iniciadores de marcadores ISSR: BEC, DAT, W814 y W844. La prueba se realizó mediante el uso de la PCR y electroforesis. Se analizaron los patrones electroforéticos y por cada iniciador se construyó una matriz binaria donde 0 es ausencia de banda, 1 es presencia de banda y NA es dato perdido. A partir de los resultados obtenidos se estimaron dos parámetros: entropía de Shannon e índice de Gini-Simpson, adecuados para detectar diversidad entre genotipos. Los análisis estadísticos fueron realizados en el ambiente y lenguaje de cómputo R. Los resultados estadísticos arrojaron datos que muestran al marcador ISSR DAT como posiblemente el mejor para estudios de diversidad genética en D. cedrosanum, seguido de los marcadores ISSR W814 e ISSR W844. El marcador ISSR BEC mostró un valor global de entropía muy bajo, lo cual puede ser una limitate en estudios de diversidad en poblaciones de sotol" |
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