Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.

Estimativas de similaridade genética entre 112 acessos de mangueira (Mangifera indica L.), de diferentes origens geográfi cas, estabelecidos no Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido foram obtidas com base em marcadores AFLP e microssatélites de forma a auxiliar atividades de melhoramento e manejo de recursos genéticos dessa espécie. O DNA dos acessos foi extraído de acordo com o protocolo CTAB 2x. Dendrogramas UPGMA foram gerados usando-se o coefi ciente de similaridade de Jaccard, com 50 alelos de 12 microssatélites e 157 amplicons AFLP de 13 combinações de primers EcoRI/ MseI. As correlações cofenéticas foram de 0,81, 0,80 e 0,94 para os dendrogramas de AFLP, microssatélites e AFLP + microssatélites, respectivamente. Quatro possíveis grupos foram observados no dendrograma de AFLP: grupo 1 com Amrapali, Malika, híbridos da Embrapa Cerrados e alguns acessos americanos; grupo 2 com acessos americanos e alguns acessos da África do Sul e do Brasil; grupo 3 com acessos brasileiros e alguns acessos da Austrália, Índia e Estados Unidos e grupo 4 com acessos de Espada, Rosa e outros de diferentes origens. Três grupos foram obtidos no dendrograma de microssatélite, ponto de corte de 0,42: grupo 1 com acessos predominantemente estrangeiros; grupo 2 com acessos brasileiros e grupo 3 com o acesso Dashehari. O dendograma de AFLP + microssatélites apresentou dois grupos principais, ponto de corte de 0,48, sem relação de origem geográfica. Os acessos analisados apresentaram coefi ciente de similaridade variando de 30% a 35% nos três endrogramas, sugerindo alta variabilidade na coleção estudada. Baseado na forma de agrupamentos dos dendrogramas, a análise com microssatélites isolada apresentou melhor resolução biológica, pois foi possível separar os acessos brasileiros dos acessos estrangeiros, de introdução recente.

Saved in:
Bibliographic Details
Main Authors: SANTOS, C. A. F., LIMA NETO, F. P.
Other Authors: CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; FRANCISCO PINHEIRO LIMA NETO, CPATSA.
Format: Folhetos biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2018
Subjects:Relações entre acessos, Acessos brasileiros, Melhoramento genético, Manga, Melhoramento Vegetal, Método de Melhoramento, Mangifera Indica, Mangoes, Genetic similarity,
Online Access:http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1103574
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id dig-infoteca-e-doc-1103574
record_format koha
spelling dig-infoteca-e-doc-11035742019-01-10T23:22:31Z Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites. SANTOS, C. A. F. LIMA NETO, F. P. CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; FRANCISCO PINHEIRO LIMA NETO, CPATSA. Relações entre acessos Acessos brasileiros Melhoramento genético Manga Melhoramento Vegetal Método de Melhoramento Mangifera Indica Mangoes Genetic similarity Estimativas de similaridade genética entre 112 acessos de mangueira (Mangifera indica L.), de diferentes origens geográfi cas, estabelecidos no Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido foram obtidas com base em marcadores AFLP e microssatélites de forma a auxiliar atividades de melhoramento e manejo de recursos genéticos dessa espécie. O DNA dos acessos foi extraído de acordo com o protocolo CTAB 2x. Dendrogramas UPGMA foram gerados usando-se o coefi ciente de similaridade de Jaccard, com 50 alelos de 12 microssatélites e 157 amplicons AFLP de 13 combinações de primers EcoRI/ MseI. As correlações cofenéticas foram de 0,81, 0,80 e 0,94 para os dendrogramas de AFLP, microssatélites e AFLP + microssatélites, respectivamente. Quatro possíveis grupos foram observados no dendrograma de AFLP: grupo 1 com Amrapali, Malika, híbridos da Embrapa Cerrados e alguns acessos americanos; grupo 2 com acessos americanos e alguns acessos da África do Sul e do Brasil; grupo 3 com acessos brasileiros e alguns acessos da Austrália, Índia e Estados Unidos e grupo 4 com acessos de Espada, Rosa e outros de diferentes origens. Três grupos foram obtidos no dendrograma de microssatélite, ponto de corte de 0,42: grupo 1 com acessos predominantemente estrangeiros; grupo 2 com acessos brasileiros e grupo 3 com o acesso Dashehari. O dendograma de AFLP + microssatélites apresentou dois grupos principais, ponto de corte de 0,48, sem relação de origem geográfica. Os acessos analisados apresentaram coefi ciente de similaridade variando de 30% a 35% nos três endrogramas, sugerindo alta variabilidade na coleção estudada. Baseado na forma de agrupamentos dos dendrogramas, a análise com microssatélites isolada apresentou melhor resolução biológica, pois foi possível separar os acessos brasileiros dos acessos estrangeiros, de introdução recente. 2019-01-10T23:22:26Z 2019-01-10T23:22:26Z 2019-01-10 2018 2019-01-11T11:11:11Z Folhetos Petrolina: Embrapa Semiárido, 2018. 1808-9968 http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1103574 pt_BR por (Embrapa Semiárido. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 135). openAccess il. 23 p.
institution EMBRAPA
collection DSpace
country Brasil
countrycode BR
component Bibliográfico
access En linea
databasecode dig-infoteca-e
tag biblioteca
region America del Sur
libraryname Sistema de bibliotecas de EMBRAPA
language pt_BR
por
topic Relações entre acessos
Acessos brasileiros
Melhoramento genético
Manga
Melhoramento Vegetal
Método de Melhoramento
Mangifera Indica
Mangoes
Genetic similarity
Relações entre acessos
Acessos brasileiros
Melhoramento genético
Manga
Melhoramento Vegetal
Método de Melhoramento
Mangifera Indica
Mangoes
Genetic similarity
spellingShingle Relações entre acessos
Acessos brasileiros
Melhoramento genético
Manga
Melhoramento Vegetal
Método de Melhoramento
Mangifera Indica
Mangoes
Genetic similarity
Relações entre acessos
Acessos brasileiros
Melhoramento genético
Manga
Melhoramento Vegetal
Método de Melhoramento
Mangifera Indica
Mangoes
Genetic similarity
SANTOS, C. A. F.
LIMA NETO, F. P.
Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
description Estimativas de similaridade genética entre 112 acessos de mangueira (Mangifera indica L.), de diferentes origens geográfi cas, estabelecidos no Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido foram obtidas com base em marcadores AFLP e microssatélites de forma a auxiliar atividades de melhoramento e manejo de recursos genéticos dessa espécie. O DNA dos acessos foi extraído de acordo com o protocolo CTAB 2x. Dendrogramas UPGMA foram gerados usando-se o coefi ciente de similaridade de Jaccard, com 50 alelos de 12 microssatélites e 157 amplicons AFLP de 13 combinações de primers EcoRI/ MseI. As correlações cofenéticas foram de 0,81, 0,80 e 0,94 para os dendrogramas de AFLP, microssatélites e AFLP + microssatélites, respectivamente. Quatro possíveis grupos foram observados no dendrograma de AFLP: grupo 1 com Amrapali, Malika, híbridos da Embrapa Cerrados e alguns acessos americanos; grupo 2 com acessos americanos e alguns acessos da África do Sul e do Brasil; grupo 3 com acessos brasileiros e alguns acessos da Austrália, Índia e Estados Unidos e grupo 4 com acessos de Espada, Rosa e outros de diferentes origens. Três grupos foram obtidos no dendrograma de microssatélite, ponto de corte de 0,42: grupo 1 com acessos predominantemente estrangeiros; grupo 2 com acessos brasileiros e grupo 3 com o acesso Dashehari. O dendograma de AFLP + microssatélites apresentou dois grupos principais, ponto de corte de 0,48, sem relação de origem geográfica. Os acessos analisados apresentaram coefi ciente de similaridade variando de 30% a 35% nos três endrogramas, sugerindo alta variabilidade na coleção estudada. Baseado na forma de agrupamentos dos dendrogramas, a análise com microssatélites isolada apresentou melhor resolução biológica, pois foi possível separar os acessos brasileiros dos acessos estrangeiros, de introdução recente.
author2 CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; FRANCISCO PINHEIRO LIMA NETO, CPATSA.
author_facet CARLOS ANTONIO FERNANDES SANTOS, CPATSA; FRANCISCO PINHEIRO LIMA NETO, CPATSA.
SANTOS, C. A. F.
LIMA NETO, F. P.
format Folhetos
topic_facet Relações entre acessos
Acessos brasileiros
Melhoramento genético
Manga
Melhoramento Vegetal
Método de Melhoramento
Mangifera Indica
Mangoes
Genetic similarity
author SANTOS, C. A. F.
LIMA NETO, F. P.
author_sort SANTOS, C. A. F.
title Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
title_short Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
title_full Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
title_fullStr Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
title_full_unstemmed Similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores AFLP e microssatélites.
title_sort similaridade genética entre acessos de mangueira com base em marcadores aflp e microssatélites.
publishDate 2018
url http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1103574
work_keys_str_mv AT santoscaf similaridadegeneticaentreacessosdemangueiracombaseemmarcadoresaflpemicrossatelites
AT limanetofp similaridadegeneticaentreacessosdemangueiracombaseemmarcadoresaflpemicrossatelites
_version_ 1779389757485219840