Caracterización de la diversidad metabólica de aislados de Xylella fastidiosa mediante fenotipado de alto rendimiento
IX Reunión del grupo Microbiología de Plantas - Sociedad Española de Microbiologia (SEM), 16 y 17 de febrero de 2021.
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dig-ias-es-10261-2686512022-05-05T01:45:42Z Caracterización de la diversidad metabólica de aislados de Xylella fastidiosa mediante fenotipado de alto rendimiento Román Ecija, Miguel Navas Cortés, Juan Antonio Landa, Blanca B. European Commission Agencia Estatal de Investigación (España) CSIC - Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA) IX Reunión del grupo Microbiología de Plantas - Sociedad Española de Microbiologia (SEM), 16 y 17 de febrero de 2021. La bacteria fitopatógena Xylella fastidiosa (Xf), habitante del xilema, es una de las principales amenazas a nivel mundial para la sanidad vegetal, ya que puede infectar más de 500 especies vegetales, y causar enfermedades severas en muchas de ellas. Esta bacteria se caracteriza por un crecimiento lento (fastidioso) y restringido al xilema que es la causa, en parte, de la dificultad para su aislamiento. A pesar de los importantes esfuerzos para conocer su diversidad genética y la patogenicidad de las nuevas cepas de la bacteria identificadas en Europa, la información disponible sobre su caracterización fenotípica es escasa, lo cual es fundamental para poder establecer posibles diferencias entre cepas que permitan explicar la infección diferencial sobre determinadas plantas huésped. El genoma de esta bacteria es muy pequeño, y se ha demostrado recientemente mediante la combinación de un modelo metabólico a escala genómica y fenotipado, que su red metabólica está completa, pero es sorprendentemente minimalista y carece de robustez. En este trabajo se ha determinado la diversidad metabólica de siete cepas de Xf pertenecientes a tres subespecies (fastidiosa, multiplex, pauca), aisladas de almendro, olivo, vid y acebuche, procedentes de España, Italia y Estados Unidos, mediante un sistema de fenotipado de alto rendimiento. Este sistema permite caracterizar la capacidad metabólica de las cepas estudiadas y establecer diferencias en el aprovechamiento de distintas rutas metabólicas, lo que contribuirá a complementar la información obtenida del genoma completo circularizado de estas cepas ya disponible. Para ello, se utilizaron microplacas de fenotipado (PM 1 a 5) de Biolog, que contienen una serie de compuestos que pueden ser usados como fuentes de carbono, nitrógeno, fósforo, azufre y suplementos nutricionales. El crecimiento de cada cepa se estimó diariamente mediante medidas de la absorbancia a 600 nm con un lector de microplacas. El análisis de las curvas de crecimiento generadas para cada compuesto indicó diferencias entre las cepas de Xf en las distintas placas utilizadas. Las mayores diferencias entre cepas se obtuvieron para algunos de los compuestos usados como fuente de carbono y de nitrógeno, y la cepa de Xf subsp. pauca ‘De Donno’, aislada del foco epidémico de Xf en Italia que presentó un perfil metabólico más diferenciado respecto a las cinco cepas aisladas en los focos en España de Xf subsp. fastidiosa y subsp. multiplex y una cepa americana de Xf subsp. fastidiosa. Financiación: Proyectos 727987 XF-ACTORS H2020-UE y E-RTA2017-00004-C06-02 ede AEI-INIA Spain, the Spanish olive oil Interprofesional and European Social Fund. Peer reviewed 2022-05-04T13:18:59Z 2022-05-04T13:18:59Z 2021-02 comunicación de congreso http://purl.org/coar/resource_type/c_5794 IX Reunión del grupo Microbiología de Plantas-SEM (2021) http://hdl.handle.net/10261/268651 http://dx.doi.org/10.13039/501100011033 http://dx.doi.org/10.13039/501100000780 es #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE# #PLACEHOLDER_PARENT_METADATA_VALUE# info:eu-repo/grantAgreement/EC/H2020/727987 info:eu-repo/grantAgreement/AEI//E-RTA2017-00004-C06-02 Sí open application/pdf |
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