Diversité génétique de Vanilla mexicana Mill. (Orchidaceae) en Guadeloupe

Vanilla mexicana Mill (Orchidaceae) est une espèce ancestrale de vanillier distribuée en Amérique centrale. En Guadeloupe, l'étude de V. mexicana vise, grâce à des marqueurs microsatellites (SSR), à évaluer les niveaux de diversité et de différenciation génétique des populations ainsi que les conséquences des stratégies de reproduction de l'espèce sur la diversité génétique et la structuration des populations. Pour ce faire 6 marqueurs microsatellites développés chez V. humblotii et V. roscheri sont sélectionnés et utilisés pour l'analyse de 133 individus (131 en Guadeloupe, 1 en Martinique et 1 au Mexique). Les analyses ont été ensuite basées sur un jeu complet de données avec 51 individus et 3 marqueurs SSR (HU03, HU07, HU09). En Guadeloupe, V. mexicana a un régime de reproduction autogame et est capable d'autopollinisation spontanée (taux de fruit set = 53,9%). Ce régime autogame explique le déficit en hétérozygotes au sein des populations guadeloupéennes. Il est aussi une des principales causes de la différenciation génétique des populations de la Guadeloupe. En incorporant les données géographiques aux analyses, un pattern d'IBD faible mais significatif est révélé. Cependant, la distribution des populations en 2 grands clusters génétiques n'est pas liée à la localisation géographique. Cette structuration pourrait être expliquée par un phénomène d'isolement par l'écologie ou par plusieurs événements de colonisation, ce qui reste à tester. Ainsi, le niveau de diversité des populations de V. mexicana en Guadeloupe est évalué plus important au niveau inter populationnel qu'au niveau intra populationnel (Fst=0,15 ; He=0,19). Néanmoins, les analyses effectuées sont limitées par l'effectif des populations et le nombre de marqueurs microsatellites utilisés. Ainsi, il est nécessaire de faire des études complémentaires pour confirmer nos résultats. Par ailleurs, des mesures de conservation sont discutées d'un point de vue de la conservation ex situ pour représenter la diversité des génotypes en Guadeloupe et in situ pour un renforcement des populations à faibles effectifs.