Vers la caractérisation de la fonction d'une nouvelle petite molécule synthétisée par des NRPS chez Xanthomonas albilineans, la bactérie responsable de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries
De nombreuses bactéries et de nombreux champignons utilisent la voie non ribosomale pour produire des peptides ou d'autres petites molécules. Cette voie, nommée NRPS pour " non-ribosomal peptide synthesis ", fait appel à des mégaenzymes modulaires qui catalyse nt l'assemblage de peptides à partir d'acides aminés protéinogéniques ou non protéinogéniques. Les petites molécules synthétisées par cette voie peuvent intervenir dans des processus très variés tels que "adaptation aux environnements défavorables, la communication ou la compétition avec d'autres microorganismes dans leur habitat naturel, ou encore l'interaction avec un hôte. Xanthomonas albilineans est l'agent causal de "échaudure des feuilles, une des principales maladies bactériennes de la canne à sucre. Le séquençage de son génome a conduit à la découverte d'un nouveau locus NRPS, appelé META-B, qui est également présent dans le génome de souches appartenant à Xanthomonas oryzae ou Xanthomonas /rans/ucens. Les analyses in silico indiquent que ce locus ne ressemble à aucun autre locus décrit à ce jour et que chaque souche séquencée produit un peptide META-B différent. La présence du locus META-B chez trois espèces de Xanthomonas phylogénétiquement distantes et associées à des plantes monocotylédones suggère que la nouvelle famille de petites molécules produites par ce locus pourrait jouer un rôle dans les interactions plante-bactérie. Un protocole permettant de surproduire et d' isoler le peptide META-B chez la souche GPE PC73 de X. abilineans a été développé. Deux approches sont actuellement mises en oeuvre pour trouver la fonction de ce peptide META-B. La première est basée sur l'étude du peptide META-B purifié (tests in vitro pour évaluer les activités antibactériennes ou antifongiques ou pour mettre en évidence un rôle dans les interactions avec la canne à sucre). La seconde est basée sur l'étude de mutants affectés dans l'expression de gènes du locus META-B (expérimentations sur canne à sucre). (Texte intégral)
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dig-cirad-fr-5728322015-09-09T18:12:20Z http://agritrop.cirad.fr/572832/ http://agritrop.cirad.fr/572832/ Vers la caractérisation de la fonction d'une nouvelle petite molécule synthétisée par des NRPS chez Xanthomonas albilineans, la bactérie responsable de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries. Sabri Souhir, Royer Monique, Völler Ginka H., Gomez Camila, Hügelland Manuela, Noëll Julie, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2014. In : 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. Paris : SFP, Résumé, 36. Rencontres plantes-bactéries. 11, Aussois, France, 3 Février 2014/7 Février 2014. Researchers Vers la caractérisation de la fonction d'une nouvelle petite molécule synthétisée par des NRPS chez Xanthomonas albilineans, la bactérie responsable de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries Sabri, Souhir Royer, Monique Völler, Ginka H. Gomez, Camila Hügelland, Manuela Noëll, Julie Süssmuth, Roderich Cociancich, Stéphane fre 2014 SFP 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014 H20 - Maladies des plantes F30 - Génétique et amélioration des plantes De nombreuses bactéries et de nombreux champignons utilisent la voie non ribosomale pour produire des peptides ou d'autres petites molécules. Cette voie, nommée NRPS pour " non-ribosomal peptide synthesis ", fait appel à des mégaenzymes modulaires qui catalyse nt l'assemblage de peptides à partir d'acides aminés protéinogéniques ou non protéinogéniques. Les petites molécules synthétisées par cette voie peuvent intervenir dans des processus très variés tels que "adaptation aux environnements défavorables, la communication ou la compétition avec d'autres microorganismes dans leur habitat naturel, ou encore l'interaction avec un hôte. Xanthomonas albilineans est l'agent causal de "échaudure des feuilles, une des principales maladies bactériennes de la canne à sucre. Le séquençage de son génome a conduit à la découverte d'un nouveau locus NRPS, appelé META-B, qui est également présent dans le génome de souches appartenant à Xanthomonas oryzae ou Xanthomonas /rans/ucens. Les analyses in silico indiquent que ce locus ne ressemble à aucun autre locus décrit à ce jour et que chaque souche séquencée produit un peptide META-B différent. La présence du locus META-B chez trois espèces de Xanthomonas phylogénétiquement distantes et associées à des plantes monocotylédones suggère que la nouvelle famille de petites molécules produites par ce locus pourrait jouer un rôle dans les interactions plante-bactérie. Un protocole permettant de surproduire et d' isoler le peptide META-B chez la souche GPE PC73 de X. abilineans a été développé. Deux approches sont actuellement mises en oeuvre pour trouver la fonction de ce peptide META-B. La première est basée sur l'étude du peptide META-B purifié (tests in vitro pour évaluer les activités antibactériennes ou antifongiques ou pour mettre en évidence un rôle dans les interactions avec la canne à sucre). La seconde est basée sur l'étude de mutants affectés dans l'expression de gènes du locus META-B (expérimentations sur canne à sucre). (Texte intégral) conference_item info:eu-repo/semantics/conferenceObject Conference info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://agritrop.cirad.fr/572832/1/document_572832.pdf application/pdf Cirad license info:eu-repo/semantics/restrictedAccess https://agritrop.cirad.fr/mention_legale.html |
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De nombreuses bactéries et de nombreux champignons utilisent la voie non ribosomale pour produire des peptides ou d'autres petites molécules. Cette voie, nommée NRPS pour " non-ribosomal peptide synthesis ", fait appel à des mégaenzymes modulaires qui catalyse nt l'assemblage de peptides à partir d'acides aminés protéinogéniques ou non protéinogéniques. Les petites molécules synthétisées par cette voie peuvent intervenir dans des processus très variés tels que "adaptation aux environnements défavorables, la communication ou la compétition avec d'autres microorganismes dans leur habitat naturel, ou encore l'interaction avec un hôte. Xanthomonas albilineans est l'agent causal de "échaudure des feuilles, une des principales maladies bactériennes de la canne à sucre. Le séquençage de son génome a conduit à la découverte d'un nouveau locus NRPS, appelé META-B, qui est également présent dans le génome de souches appartenant à Xanthomonas oryzae ou Xanthomonas /rans/ucens. Les analyses in silico indiquent que ce locus ne ressemble à aucun autre locus décrit à ce jour et que chaque souche séquencée produit un peptide META-B différent. La présence du locus META-B chez trois espèces de Xanthomonas phylogénétiquement distantes et associées à des plantes monocotylédones suggère que la nouvelle famille de petites molécules produites par ce locus pourrait jouer un rôle dans les interactions plante-bactérie. Un protocole permettant de surproduire et d' isoler le peptide META-B chez la souche GPE PC73 de X. abilineans a été développé. Deux approches sont actuellement mises en oeuvre pour trouver la fonction de ce peptide META-B. La première est basée sur l'étude du peptide META-B purifié (tests in vitro pour évaluer les activités antibactériennes ou antifongiques ou pour mettre en évidence un rôle dans les interactions avec la canne à sucre). La seconde est basée sur l'étude de mutants affectés dans l'expression de gènes du locus META-B (expérimentations sur canne à sucre). (Texte intégral) |
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