Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana)
Le protocole s'applique à la caractérisation de la structure du génome et à l'évolution des génomes de M. acuminata et de M. balbisiana ; à la construction de cartes physiques autour des marqueurs d'intérêt et des QTLs ; aux études de génomique comparative avec d'autre espèce de monocotylédones ; à l'étude des modèles d'intégration du virus BSV dans les génomes nucléaires de la banane. Le principe, les principaux avantages, le matériel végétal utilisé, le temps nécessaire et les résultats attendus sont présentés. Matériel et méthodes. Cette partie décrit le matériel de laboratoire nécessaire, et les protocoles permettant l'isolement et la lyse des noyaux de cellules de bananier ; la digestion Hind III de ADN à haut poids moléculaire (HPM) et l'analyse électrophorèse sur gels à champ pulsé ; la digestion Hind III à grande échelle de ADN à HPM et ligation au vecteur pINDIGOBAC-5 ; l'analyse des clones recombinants de BAC. Elle mentionne les principaux problèmes pouvant se poser. Résultats. Les protocoles présentés permettent de construire des bibliothèques de BAC à partir d'espèces du genre Musa. Ces bibliothèques peuvent être utilisées pour construire des cartes physiques et sélectionner des régions du génome à séquencer.
id |
dig-cirad-fr-547538 |
---|---|
record_format |
koha |
spelling |
dig-cirad-fr-5475382024-01-28T16:39:13Z http://agritrop.cirad.fr/547538/ http://agritrop.cirad.fr/547538/ Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana). Piffanelli Pietro, Vilarinhos Alberto Duarte, Safar Jan, Sabau Xavier, Dolezel Jaroslav. 2008. Fruits, 63 (6) : 375-379.https://doi.org/10.1051/fruits:2008037 <https://doi.org/10.1051/fruits:2008037> Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) Piffanelli, Pietro Vilarinhos, Alberto Duarte Safar, Jan Sabau, Xavier Dolezel, Jaroslav eng 2008 Fruits F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 France http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 Le protocole s'applique à la caractérisation de la structure du génome et à l'évolution des génomes de M. acuminata et de M. balbisiana ; à la construction de cartes physiques autour des marqueurs d'intérêt et des QTLs ; aux études de génomique comparative avec d'autre espèce de monocotylédones ; à l'étude des modèles d'intégration du virus BSV dans les génomes nucléaires de la banane. Le principe, les principaux avantages, le matériel végétal utilisé, le temps nécessaire et les résultats attendus sont présentés. Matériel et méthodes. Cette partie décrit le matériel de laboratoire nécessaire, et les protocoles permettant l'isolement et la lyse des noyaux de cellules de bananier ; la digestion Hind III de ADN à haut poids moléculaire (HPM) et l'analyse électrophorèse sur gels à champ pulsé ; la digestion Hind III à grande échelle de ADN à HPM et ligation au vecteur pINDIGOBAC-5 ; l'analyse des clones recombinants de BAC. Elle mentionne les principaux problèmes pouvant se poser. Résultats. Les protocoles présentés permettent de construire des bibliothèques de BAC à partir d'espèces du genre Musa. Ces bibliothèques peuvent être utilisées pour construire des cartes physiques et sélectionner des régions du génome à séquencer. article info:eu-repo/semantics/article Journal Article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://agritrop.cirad.fr/547538/1/document_547538.pdf application/pdf Cirad license info:eu-repo/semantics/openAccess https://agritrop.cirad.fr/mention_legale.html https://doi.org/10.1051/fruits:2008037 10.1051/fruits:2008037 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1051/fruits:2008037 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/purl/https://doi.org/10.1051/fruits:2008037 info:eu-repo/semantics/reference/purl/https://revues.cirad.fr/index.php/fruits |
institution |
CIRAD FR |
collection |
DSpace |
country |
Francia |
countrycode |
FR |
component |
Bibliográfico |
access |
En linea |
databasecode |
dig-cirad-fr |
tag |
biblioteca |
region |
Europa del Oeste |
libraryname |
Biblioteca del CIRAD Francia |
language |
eng |
topic |
F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 |
spellingShingle |
F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 Piffanelli, Pietro Vilarinhos, Alberto Duarte Safar, Jan Sabau, Xavier Dolezel, Jaroslav Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
description |
Le protocole s'applique à la caractérisation de la structure du génome et à l'évolution des génomes de M. acuminata et de M. balbisiana ; à la construction de cartes physiques autour des marqueurs d'intérêt et des QTLs ; aux études de génomique comparative avec d'autre espèce de monocotylédones ; à l'étude des modèles d'intégration du virus BSV dans les génomes nucléaires de la banane. Le principe, les principaux avantages, le matériel végétal utilisé, le temps nécessaire et les résultats attendus sont présentés. Matériel et méthodes. Cette partie décrit le matériel de laboratoire nécessaire, et les protocoles permettant l'isolement et la lyse des noyaux de cellules de bananier ; la digestion Hind III de ADN à haut poids moléculaire (HPM) et l'analyse électrophorèse sur gels à champ pulsé ; la digestion Hind III à grande échelle de ADN à HPM et ligation au vecteur pINDIGOBAC-5 ; l'analyse des clones recombinants de BAC. Elle mentionne les principaux problèmes pouvant se poser. Résultats. Les protocoles présentés permettent de construire des bibliothèques de BAC à partir d'espèces du genre Musa. Ces bibliothèques peuvent être utilisées pour construire des cartes physiques et sélectionner des régions du génome à séquencer. |
format |
article |
topic_facet |
F30 - Génétique et amélioration des plantes Musa acuminata Musa balbisiana méthodologie génome génie génétique locus des caractères quantitatifs électrophorèse chromosome adn marqueur génétique virus des végétaux carte génétique http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4994 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4995 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_12522 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37974 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1598 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5985 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3081 |
author |
Piffanelli, Pietro Vilarinhos, Alberto Duarte Safar, Jan Sabau, Xavier Dolezel, Jaroslav |
author_facet |
Piffanelli, Pietro Vilarinhos, Alberto Duarte Safar, Jan Sabau, Xavier Dolezel, Jaroslav |
author_sort |
Piffanelli, Pietro |
title |
Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
title_short |
Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
title_full |
Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
title_fullStr |
Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
title_full_unstemmed |
Construction of bacterial artificial chromosome (BAC) libraries of banana (Musa acuminata and Musa balbisiana) |
title_sort |
construction of bacterial artificial chromosome (bac) libraries of banana (musa acuminata and musa balbisiana) |
url |
http://agritrop.cirad.fr/547538/ http://agritrop.cirad.fr/547538/1/document_547538.pdf |
work_keys_str_mv |
AT piffanellipietro constructionofbacterialartificialchromosomebaclibrariesofbananamusaacuminataandmusabalbisiana AT vilarinhosalbertoduarte constructionofbacterialartificialchromosomebaclibrariesofbananamusaacuminataandmusabalbisiana AT safarjan constructionofbacterialartificialchromosomebaclibrariesofbananamusaacuminataandmusabalbisiana AT sabauxavier constructionofbacterialartificialchromosomebaclibrariesofbananamusaacuminataandmusabalbisiana AT dolezeljaroslav constructionofbacterialartificialchromosomebaclibrariesofbananamusaacuminataandmusabalbisiana |
_version_ |
1792497083477917696 |