Développement d'un outil de diagnostic moléculaire des Mycosphaerella spp champignons pathogènes du bananier

Les maladies foliaires, provoquées par les champignons Ascomycètes Mycosphaerella fijiensis, M. musicola et M. eumusae, constituent l'un des principaux facteurs limitant de la production des bananiers. Ces trois espèces sont actuellement identifiées à l'aide de critères morphologiques. Ce principe de détermination limite l'étude de l'aire de répartition de ces espèces dans les zones de production. L'objectif de ce travail était de développer un outil de diagnostic moléculaire, simple à utiliser, à l'aide d'amorces PCR spécifiques. Des couples d'amorces ont été définies à partir de fragment d'ADN contenant des motifs microsatellites pour les trois parasites étudiés dans les séquences flanquant ces motifs. La spécificité de ces couples a été testée sur un ensemble d'isolats appartenant aux trois espèces et à d'autres espèces apparentées présentes sur le bananier. Soixante-cinq couples d'amorces au total ont été définîes à partir de fragments d'ADN des trois parasites. Quatre d'entre-eux sont spécifiques à M. fijiensis, un à M. eumusae et à M. musicola. Ces couples pourront servir à l'élaboration d'un test de diagnostic. La plupart des autres couples permettent une amplification de plus de 80% des isolats des espèces ayant servies à les définir. Une augmentation de la température d'hybridation de la réaction PCR permettra certainement d'obtenir de nouvelles amorces spécifiques. Pour chacune des espèces pathogènes, environ 20 couples d'amorces sont utilisables en tant que marqueurs génétiques pour l'étude de la structure des populations.