Les méthodes de marquage biochimique et moléculaire
Les marqueurs biochimiques et moléculaires ont de nombreuses applications en génétique des plantes. Ils permettent d'observer, de façon plus ou moins fine, le polymorphisme de séquences de l'ADN d'un certain nombre de sites ou de locus répartis sur le génome. Plus précisément, les marqueurs biochimiques révèlent le polymorphisme des séquences de certaines protéines et donc, de façon indirecte, le polymorphisme des séquences d'ADN à partir desquelles elles sont traduites. Les marqueurs moléculaires révèlent directement le polymorphisme de l'ADN, les séquences ciblées correspondant ou non à des séquences codantes. Ce chapitre vise à préciser les caractéristiques des différentes techniques de marquage biochimique et moléculaire disponibles pour étudier la diversité des collections de matériel génétique chez les plantes. Il existe plus d'une dizaine de techniques de marquage génétique. Cinq techniques, largement répandues ou prometteuses sont abordées : les isoenzymes, les RFLP (restriction fragment lengh polymorphism), les RAPD (random amplified polymorphic DNA), les AFLP (amplified fragment length polymorphism) et les microsatellites. Le principe de chaque technique est brièvement décrit. Après avoir rappelé la structure du génome des plantes, on décrit les aspects méthodologiques - séquences ciblées, nature et niveau du polymorphisme détecté, similarité génétique - et pratiques - coût, rapidité de mise en oeuvre, infrastructures nécessaires - qui différencient ces cinq techniques
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dig-cirad-fr-3917062024-04-10T13:52:05Z http://agritrop.cirad.fr/391706/ http://agritrop.cirad.fr/391706/ Les méthodes de marquage biochimique et moléculaire. Grivet Laurent, Noyer Jean-Louis. 1999. In : Diversité génétique des plantes tropicales cultivées = Genetic diversity of cultivated tropical plants. Hamon Perla (ed.), Seguin Marc (ed.), Perrier Xavier (ed.), Glaszmann Jean-Christophe (ed.). Montpellier : CIRAD, 13-41. ISBN 2-87614-344-8 Les méthodes de marquage biochimique et moléculaire Grivet, Laurent Noyer, Jean-Louis fre 1999 CIRAD Diversité génétique des plantes tropicales cultivées F30 - Génétique et amélioration des plantes U30 - Méthodes de recherche plante de culture tropicale marqueur génétique génome polymorphisme variation génétique séquence nucléotidique banque de gènes isoenzyme RFLP RAPD microsatellite http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34136 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6088 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15975 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27583 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_11116 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15987 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34255 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_36341 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_36574 Les marqueurs biochimiques et moléculaires ont de nombreuses applications en génétique des plantes. Ils permettent d'observer, de façon plus ou moins fine, le polymorphisme de séquences de l'ADN d'un certain nombre de sites ou de locus répartis sur le génome. Plus précisément, les marqueurs biochimiques révèlent le polymorphisme des séquences de certaines protéines et donc, de façon indirecte, le polymorphisme des séquences d'ADN à partir desquelles elles sont traduites. Les marqueurs moléculaires révèlent directement le polymorphisme de l'ADN, les séquences ciblées correspondant ou non à des séquences codantes. Ce chapitre vise à préciser les caractéristiques des différentes techniques de marquage biochimique et moléculaire disponibles pour étudier la diversité des collections de matériel génétique chez les plantes. Il existe plus d'une dizaine de techniques de marquage génétique. Cinq techniques, largement répandues ou prometteuses sont abordées : les isoenzymes, les RFLP (restriction fragment lengh polymorphism), les RAPD (random amplified polymorphic DNA), les AFLP (amplified fragment length polymorphism) et les microsatellites. Le principe de chaque technique est brièvement décrit. Après avoir rappelé la structure du génome des plantes, on décrit les aspects méthodologiques - séquences ciblées, nature et niveau du polymorphisme détecté, similarité génétique - et pratiques - coût, rapidité de mise en oeuvre, infrastructures nécessaires - qui différencient ces cinq techniques book_section info:eu-repo/semantics/bookPart Chapter info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://agritrop.cirad.fr/391706/1/ID391706.pdf text Cirad license info:eu-repo/semantics/openAccess https://agritrop.cirad.fr/mention_legale.html http://agritrop.cirad.fr/189703/ http://agritrop.cirad.fr/515310/ |
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Les marqueurs biochimiques et moléculaires ont de nombreuses applications en génétique des plantes. Ils permettent d'observer, de façon plus ou moins fine, le polymorphisme de séquences de l'ADN d'un certain nombre de sites ou de locus répartis sur le génome. Plus précisément, les marqueurs biochimiques révèlent le polymorphisme des séquences de certaines protéines et donc, de façon indirecte, le polymorphisme des séquences d'ADN à partir desquelles elles sont traduites. Les marqueurs moléculaires révèlent directement le polymorphisme de l'ADN, les séquences ciblées correspondant ou non à des séquences codantes. Ce chapitre vise à préciser les caractéristiques des différentes techniques de marquage biochimique et moléculaire disponibles pour étudier la diversité des collections de matériel génétique chez les plantes. Il existe plus d'une dizaine de techniques de marquage génétique. Cinq techniques, largement répandues ou prometteuses sont abordées : les isoenzymes, les RFLP (restriction fragment lengh polymorphism), les RAPD (random amplified polymorphic DNA), les AFLP (amplified fragment length polymorphism) et les microsatellites. Le principe de chaque technique est brièvement décrit. Après avoir rappelé la structure du génome des plantes, on décrit les aspects méthodologiques - séquences ciblées, nature et niveau du polymorphisme détecté, similarité génétique - et pratiques - coût, rapidité de mise en oeuvre, infrastructures nécessaires - qui différencient ces cinq techniques |
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