Isolation and characterization of a satellite DNA family in the Saccharum complex
La migration électrophorétique, sur gel d'agarose, de fragments résultant d'une restriction par l'endonucléase Taql d'ADN génomique, a permie d'isoler un ADN satellite de 371 pb spécifique du genre #Erianthus#, EaCIRI. Cette séquence présente 77% d'homologie avec un ADN satellite de 365 pb spécifique de #Helictotrichon convolutum#, ainsi que 72% d'homologie avec une séquence répétée en tandem de 353 pb spécifique de #Oryza sativa#. Des amorces PCR définies dans les zones conservées de ces séquences répétées ont permis d'isoler d'autres ADN satellites chez différents représentants du complexe #Saccharum# : SoCIRI chez #Saccharum officinarum#. SrCIR1 chez #Sacharum robustum#, SsCIR1 et SsCIR2 chez #Saccharum spontaneum# ainsi que MsCIR1 chez #Miscanthus sinensis#. EaCIR1 et SoCIR1 ont été localisés dans les régions subtélométriques des chromosomes, par hybridation #in situ# en fluorescence. La réalisation d'hybridations de type Southern, en utilisant deux représentants de cette famille de séquences répétées comme sondes, a illustré l'existence de la spécificité d'espèce de ces satellites, et démontré l'existence d'éléments répétés similaires chez le sorgho et la maïs.
| Main Authors: | , , , , |
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| Format: | article biblioteca |
| Language: | eng |
| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, Saccharum, adn, électrophorèse, Erianthus, séquence nucléotidique, PCR, Miscanthus sinensis, hybridation, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6725, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2347, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2523, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_33698, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27583, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34079, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_33383, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3706, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/391117/ |
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