Intraspecific genomic variation within Xanthomonas albilineans, the sugarcane leaf scald pathogen

Pour mieux comprendre la nature des récentes épidémies d'échaudure des feuilles de canne à sucre dans de nombreuses régions de production de canne à sucre du monde dont la Floride, la Guadeloupe, la Louisiane, Maurice, Taiwan et le Texas, une étude de la variation génétique mondiale du pathogène a été entreprise. Un total de 218 souches issues de 31 localisations géographiques ont été examinées. L'ADN génomique de chaque souche a été analysé avec l'enzyme de restriction SpeI, et les fragments ont été séparés par électrophorèse sur gel (PFGE). Un total de 102 bandes ont été identifiées et 54 schémas d'ADN différents (haplotypes) ont été observés. Les différentes épidémies ont été attribuées à l'introduction de souches appartenant à tel ou tel groupe PFGE. La dispersion par inadvertance du pathogène à l'intérieur des plantes a été détectée par une expérience complémentaire. De plus, la variation des souches pourrait être associée au moins en partie avec des facteurs gouvernant la diffusion de plante à plante du pathogène dans la nature

Bibliographic Details

Main Authors:	Davis, Michael J., Rott, Philippe, Warmuth, C.J., Chatenet, Michèle, Baudin, Pierre
Format:	article biblioteca
Language:	eng
Subjects:	H20 - Maladies des plantes, maladie des plantes, Saccharum, échaudure, agent pathogène, Xanthomonas albilineans, variation génétique, empreinte ADN, épidémiologie, quarantaine, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5962, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6725, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24895, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5630, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_27422, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15975, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34258, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2615, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6402,
Online Access:	http://agritrop.cirad.fr/389097/ http://agritrop.cirad.fr/389097/1/389097.pdf
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