Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson

Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biología

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Uchima Flores, Mariella Hiromi
Other Authors: Moreno Díaz de Saco, Patricia Angélica
Format: info:eu-repo/semantics/bachelorThesis biblioteca
Language:spa
Published: Universidad Nacional Agraria La Molina 2018
Subjects:Polymnia sonchifolia, Genes, Fructosa, Raices, ARN, Síntesis de proteínas, Análisis de tejidos, Perú, Yacon, Smallanthus sonchifolius, Gen putativo, Fructanos, Fructano exohidrolasa, http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07,
Online Access:https://hdl.handle.net/20.500.12996/3834
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
id dig-ban-20.500.12996-3834
record_format koha
institution UNALAM
collection DSpace
country Perú
countrycode PE
component Bibliográfico
access En linea
databasecode dig-ban
tag biblioteca
region America del Sur
libraryname Biblioteca Agrícola Nacional de la Molina
language spa
topic Polymnia sonchifolia
Genes
Fructosa
Raices
ARN
Síntesis de proteínas
Análisis de tejidos
Perú
Yacon
Smallanthus sonchifolius
Gen putativo
Fructanos
Fructano exohidrolasa
http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
Polymnia sonchifolia
Genes
Fructosa
Raices
ARN
Síntesis de proteínas
Análisis de tejidos
Perú
Yacon
Smallanthus sonchifolius
Gen putativo
Fructanos
Fructano exohidrolasa
http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
spellingShingle Polymnia sonchifolia
Genes
Fructosa
Raices
ARN
Síntesis de proteínas
Análisis de tejidos
Perú
Yacon
Smallanthus sonchifolius
Gen putativo
Fructanos
Fructano exohidrolasa
http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
Polymnia sonchifolia
Genes
Fructosa
Raices
ARN
Síntesis de proteínas
Análisis de tejidos
Perú
Yacon
Smallanthus sonchifolius
Gen putativo
Fructanos
Fructano exohidrolasa
http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
Uchima Flores, Mariella Hiromi
Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
description Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biología
author2 Moreno Díaz de Saco, Patricia Angélica
author_facet Moreno Díaz de Saco, Patricia Angélica
Uchima Flores, Mariella Hiromi
format info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
topic_facet Polymnia sonchifolia
Genes
Fructosa
Raices
ARN
Síntesis de proteínas
Análisis de tejidos
Perú
Yacon
Smallanthus sonchifolius
Gen putativo
Fructanos
Fructano exohidrolasa
http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07
author Uchima Flores, Mariella Hiromi
author_sort Uchima Flores, Mariella Hiromi
title Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
title_short Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
title_full Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
title_fullStr Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
title_full_unstemmed Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson
title_sort caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón smallanthus sonchifolius (poepp. & end..) h. robinson
publisher Universidad Nacional Agraria La Molina
publishDate 2018
url https://hdl.handle.net/20.500.12996/3834
work_keys_str_mv AT uchimafloresmariellahiromi caracterizaciondelgenputativoresponsabledelaactividadexohidrolasaenorganosreservantesdeyaconsmallanthussonchifoliuspoeppendhrobinson
_version_ 1756090156738150400
spelling dig-ban-20.500.12996-38342023-01-05T08:50:37Z Caracterización del gen putativo responsable de la actividad exo-hidrolasa en órganos reservantes de yacón Smallanthus sonchifolius (Poepp. & End..) H. Robinson Uchima Flores, Mariella Hiromi Moreno Díaz de Saco, Patricia Angélica Cabrera Pintado, Rosa María Polymnia sonchifolia Genes Fructosa Raices ARN Síntesis de proteínas Análisis de tejidos Perú Yacon Smallanthus sonchifolius Gen putativo Fructanos Fructano exohidrolasa http://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07 Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biología La presente investigación tuvo como objetivo la caracterización del gen responsable de la actividad fructano-exohidrolasas a partir de las raíces reservantes de yacón (Smallanthus sonchifolius) obtenidas de la estación experimental “Baños del Inca” en Cajamarca, perteneciente al Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA). La estandarización de un protocolo de extracción de RNA total a partir de las raíces reservantes de yacón se realizó utilizando el protocolo CTAB, las modificaciones del protocolo se basaron en el aumento de antioxidantes. El diseño de primers permitió la obtención de secuencias codificantes traslapadas del gen FEH mediante la técnica RT-PCR, así como para obtención del extremo 3´ del ARNm. Para esta región se utilizó técnicas variantes de PCR como: RACE, IPCR y semi-Nested, siendo esta última esencial para la obtención del extremo no codificante 3´. El ensamblaje de los fragmentos permitió determinar cerca del 80 por ciento de la secuencia y la construcción del árbol filogenético estableció que la secuencia en estudio corresponde a la 1-fructano exohidrolasa (1-FEH) en yacón, presentando un alto grado de identidad respecto a las 1-FEHs de: C. intybus (88.5 por ciento), H. tuberosus (88.2 por ciento), V. herbácea (86.5 por ciento) y A. lappa (85 por ciento). La propuesta de la estructura de la enzima por homología, realizada mediante los programas: Swiss Model y PyMOL mostró similitud estructural respecto a la estructura base de las glicósido hidrolasa 32, así también la presencia de dos de los tres residuos claves pertenecientes a la triada catalítica y la ausencia de sitios de N-glucosilación cerca a la hendidura. The objective of the present investigation was to characterize the gene responsible for the fructan-exohydrolases activity from the reservant roots of yacon (Smallanthus sonchifolius) obtained from the "Baños del Inca" experimental station in Cajamarca, belonging to the National Institute of Agrarian Innovation (INIA). The standardization of a total RNA extraction protocol from yacon reservant roots was carried out using the CTAB protocol, the modifications of the protocol were based on the increase of antioxidants. The design of primers allowed obtaining of overlapping coding sequences of the FEH gene by the RT-PCR technique, as well as for obtaining the 3'-end of the mRNA. For this region, PCR techniques were used, such as: RACE, IPCR and semi-Nested, the latter being essential for obtaining the 3'-non-coding end. The assembly of the fragments allowed to determine about 80 percent of the sequence and the construction of the phylogenetic tree established that the sequence under study corresponds to 1-fructan exohydrolase (1-FEH) in yacon, presenting a high degree of identity with respect to the 1-FEHs of: C. intybus (88.5 percent), H. tuberosus (88.2 percent), V. herbacea (86.5 percent) and A. lappa (85 percent). The proposal of the structure of the enzyme by homology, carried out through the programs: Swiss Model and PyMOL showed structural similarity with respect to the base structure of glycoside hydrolases 32, as well as the presence of two of the three key residues belonging to the catalytic triad. and the absence of N-glycosylation sites near the cleft. 2019-02-07T14:22:04Z 2019-02-07T14:22:04Z 2018 info:eu-repo/semantics/bachelorThesis info:eu-repo/semantics/publishedVersion F30.U3-T BAN UNALM https://hdl.handle.net/20.500.12996/3834 spa info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ application/pdf application/pdf application/pdf Universidad Nacional Agraria La Molina PE https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis https://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional 511206 Espejo Joya, Rosa Amelia Blas Sevillano, Raúl Humberto Mansilla Samaniego, Roberto Carlos 47632934 https://orcid.org/0000-0001-7375-440X https://orcid.org/0000-0003-2396-8674 08202139 09626188 Biología Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias Biólogo