Amplificación cruzada de microsatélites para estudios poblacionales de dos especies de camarón del género Litopenaeus en Colombia.

Los microsatélites son marcadores moleculares usados con frecuencia en estudios de genética de poblaciones, aunque su desarrollo es un proceso costoso y prolongado dada su elevada especificidad. Un método que permite ahorrar tiempo y dinero es la amplificación cruzada, que consiste en amplificar el ADN de una especie determinada (especie objetivo) utilizando cebadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). Usando este método se evalúo la idoneidad de 15 loci microsatélites, desarrollados para las especies Litopenaeus setiferus y L. vannamei, para estudiar regiones microsatélites de L. schmitti y L. occidentalis. Cinco cebadores son adecuados para amplificar consistentemente microsatélites polimórficos en L. schmitti y cuatro en L. occidentalis. Los resultados muestran la utilidad de la amplificación cruzada con estos cebadores para estudios de genética poblacional de ambas especies.

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Main Authors: Fresneda-Rodríguez, Adriana, Chasqui-Velasco, Luis, Alonso-Carvajal, David
Format: Journal Contribution biblioteca
Language:Spanish / Castilian
Published: 2013
Subjects:Amplificación cruzada, Cross-amplification, Molecular markers, Marcadores moleculares, Litopenaeus schmitti, Litopenaeus occidentalis, Microsatélites, ASFA15::S::Satellites, ASFA15::P::Population studies,
Online Access:http://hdl.handle.net/1834/6724
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spelling dig-aquadocs-1834-67242021-05-19T06:39:15Z Amplificación cruzada de microsatélites para estudios poblacionales de dos especies de camarón del género Litopenaeus en Colombia. Microsatellite cross-amplification for population genetic studies in shrimp species of the genus Litopenaeus in Colombia. Fresneda-Rodríguez, Adriana Chasqui-Velasco, Luis Alonso-Carvajal, David Amplificación cruzada Cross-amplification Molecular markers Marcadores moleculares Litopenaeus schmitti Litopenaeus occidentalis Microsatélites ASFA15::S::Satellites ASFA15::P::Population studies Los microsatélites son marcadores moleculares usados con frecuencia en estudios de genética de poblaciones, aunque su desarrollo es un proceso costoso y prolongado dada su elevada especificidad. Un método que permite ahorrar tiempo y dinero es la amplificación cruzada, que consiste en amplificar el ADN de una especie determinada (especie objetivo) utilizando cebadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). Usando este método se evalúo la idoneidad de 15 loci microsatélites, desarrollados para las especies Litopenaeus setiferus y L. vannamei, para estudiar regiones microsatélites de L. schmitti y L. occidentalis. Cinco cebadores son adecuados para amplificar consistentemente microsatélites polimórficos en L. schmitti y cuatro en L. occidentalis. Los resultados muestran la utilidad de la amplificación cruzada con estos cebadores para estudios de genética poblacional de ambas especies. Microsatellites are molecular markers frequently used in population genetic studies despite of the high cost, and long time involved in developing them, mainly due to their high specificity. One method to save money and time is cross-amplification, which is the DNA amplification of the target species using primers developed for a different species. By using cross-amplification, the suitability of 15 developed microsatellite loci from Litopenaeus setiferus and L. vannamei to amplify microsatellite regions of L. schmitti and L. occidentalis was evaluated. Five primers showed consistent amplification and were polymorphic in L. schmitti and four in L. occidentalis . These results point out the usefulness of cross-amplification with these primers for population genetics studies of both species. Published 2015-04-24T15:35:48Z 2015-04-24T15:35:48Z 2013 Journal Contribution Refereed 0122-9761 http://hdl.handle.net/1834/6724 es pp.121-129 Colombia
institution UNESCO
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Fresneda-Rodríguez, Adriana
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Amplificación cruzada de microsatélites para estudios poblacionales de dos especies de camarón del género Litopenaeus en Colombia.
description Los microsatélites son marcadores moleculares usados con frecuencia en estudios de genética de poblaciones, aunque su desarrollo es un proceso costoso y prolongado dada su elevada especificidad. Un método que permite ahorrar tiempo y dinero es la amplificación cruzada, que consiste en amplificar el ADN de una especie determinada (especie objetivo) utilizando cebadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). Usando este método se evalúo la idoneidad de 15 loci microsatélites, desarrollados para las especies Litopenaeus setiferus y L. vannamei, para estudiar regiones microsatélites de L. schmitti y L. occidentalis. Cinco cebadores son adecuados para amplificar consistentemente microsatélites polimórficos en L. schmitti y cuatro en L. occidentalis. Los resultados muestran la utilidad de la amplificación cruzada con estos cebadores para estudios de genética poblacional de ambas especies.
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