Código de barras de ADN de las especies cubanas de peces dulceacuícolas.
En el presente trabajo se realizó el análisis del código de barras ADN de 24 especies de la ictiofauna dulceacuícola cubana. Para ello, se secuenciaron 652pb del gen mitocondrial citocromo oxidasa I (COI) de 96 individuos provenientes de diferentes áreas geográficas y representativos, en la mayoría de los casos, de la distribución espacial de cada especie. En el análisis se utilizó la distancia genética Kimura 2 parámetros (K2P), considerando como cota superior el valor de 3%, para identificar los límites de divergencia entre especies. Complementariamente se llevó a cabo un análisis de agregación poblacional para identificar grupos poblacionales indicativos de linajes evolutivos independientes. El estimado promedio de divergencia genética entre individuos coespecíficos fue de 0.96%, mientras que el valor encontrado entre especies congenéricas alcanzó el 10.2%. La identificación de las especies a través de este marcador molecular coincidió en un 96% con la clasificación taxonómica establecida. Solo se observaron incongruencias en el caso del género Rivulus, donde no se pudo identificar molecularmente a la especie R. insulaepinorum. Por otra parte, el género Gambusia presentó una mayor diversidad de especies, al identificarse varios linajes evolutivos significativos. De manera general, el código de barras del ADN constituye una herramienta eficaz para la identificación de los peces de agua dulce de Cuba y una vía rápida para identificar posibles linajes independientes que puedan ser motivo de estudios posteriores más profundos.
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Published: |
2008
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Subjects: | cDNA, Genes, Fishes, Fish wastes, |
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cDNA Genes Fishes Fish wastes cDNA Genes Fishes Fish wastes Lara Lorenzo, A. Código de barras de ADN de las especies cubanas de peces dulceacuícolas. |
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En el presente trabajo se realizó el análisis del código de barras ADN de 24 especies de la
ictiofauna dulceacuícola cubana. Para ello, se secuenciaron 652pb del gen mitocondrial
citocromo oxidasa I (COI) de 96 individuos provenientes de diferentes áreas geográficas y
representativos, en la mayoría de los casos, de la distribución espacial de cada especie. En
el análisis se utilizó la distancia genética Kimura 2 parámetros (K2P), considerando como
cota superior el valor de 3%, para identificar los límites de divergencia entre especies.
Complementariamente se llevó a cabo un análisis de agregación poblacional para
identificar grupos poblacionales indicativos de linajes evolutivos independientes. El
estimado promedio de divergencia genética entre individuos coespecíficos fue de 0.96%,
mientras que el valor encontrado entre especies congenéricas alcanzó el 10.2%. La
identificación de las especies a través de este marcador molecular coincidió en un 96% con
la clasificación taxonómica establecida. Solo se observaron incongruencias en el caso del
género Rivulus, donde no se pudo identificar molecularmente a la especie R.
insulaepinorum. Por otra parte, el género Gambusia presentó una mayor diversidad de
especies, al identificarse varios linajes evolutivos significativos. De manera general, el
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dig-aquadocs-1834-55142021-05-19T06:35:08Z Código de barras de ADN de las especies cubanas de peces dulceacuícolas. Lara Lorenzo, A. García Machado, E. Ponce de León García, J. L. Centro de Investigaciones Marinas Universidad de La Habana cDNA Genes Fishes Fish wastes En el presente trabajo se realizó el análisis del código de barras ADN de 24 especies de la ictiofauna dulceacuícola cubana. Para ello, se secuenciaron 652pb del gen mitocondrial citocromo oxidasa I (COI) de 96 individuos provenientes de diferentes áreas geográficas y representativos, en la mayoría de los casos, de la distribución espacial de cada especie. En el análisis se utilizó la distancia genética Kimura 2 parámetros (K2P), considerando como cota superior el valor de 3%, para identificar los límites de divergencia entre especies. Complementariamente se llevó a cabo un análisis de agregación poblacional para identificar grupos poblacionales indicativos de linajes evolutivos independientes. El estimado promedio de divergencia genética entre individuos coespecíficos fue de 0.96%, mientras que el valor encontrado entre especies congenéricas alcanzó el 10.2%. La identificación de las especies a través de este marcador molecular coincidió en un 96% con la clasificación taxonómica establecida. Solo se observaron incongruencias en el caso del género Rivulus, donde no se pudo identificar molecularmente a la especie R. insulaepinorum. Por otra parte, el género Gambusia presentó una mayor diversidad de especies, al identificarse varios linajes evolutivos significativos. De manera general, el código de barras del ADN constituye una herramienta eficaz para la identificación de los peces de agua dulce de Cuba y una vía rápida para identificar posibles linajes independientes que puedan ser motivo de estudios posteriores más profundos. Unpublished Rivulus R. insulaepinorum Gambusia Cuba 2014-06-19T19:23:45Z 2014-06-19T19:23:45Z 2008 Theses and Dissertations Master thesis http://hdl.handle.net/1834/5514 es 1. Alayo, P., 1973. Lista de peces fluviatiles de Cuba. Torreia. Nueva serie (29): 53pp. 2. Alayo, P., 1974. Guía elemental de las aguas dulces de Cuba. Torreia. Nueva serie (37): 66-68. 3. Anónimo, 2007. How DNA Barcoding Can Help Science. http://www.sciencedaily.com/ 4. Avise, J.C., 1994. Molecular markers, natural history and evolution. Chapman and Hall, edits. N. Y. London. 5. Avise, J.C.; J. Arnold; M. R. Ball; E. Berminghan; T. Lamb; J.E. Neigel; C.A Reeb and N.C. Saunders, 1987. Intraspecific Phylogeography: the mitochondrial DNA Bridge between population genetics and systematics. Annual Review of Ecology and Systematics 18: 489-522. 6. Ayala, F.J., 1997. Vagaries of the molecular clock. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94: 7776–7783. 7. Ballard, J.W.O. and M.C. Whitlock, 2004. 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