Transferibilidade de locos SSR de Phoenix dactylifera para Astrocaryum vulgare.

Este trabalho foi realizado com o objetivo de testar a transferibilidade de locos SSR de Phoenix dactylifera para a espécie Astrocaryum vulgare. Para isso, foram aplicados onze locos desenvolvidos para P. dactylifera com variação de seis temperaturas de anelamento, em DNA de seis indivíduos adultos de A. vulgare. As reações de amplificação foram conduzidas de acordo com o protocolo desenvolvido com pequenas adaptações. Os produtos da amplificação foram aplicados em gel de agarose ultra pura a γ,η%, corado com brometo de etídio e submetido à eletroforese horizontal por duas horas. Em seguida, os géis foram fotodocumentados e as imagens armazenadas digitalmente. A transferibilidade dos locos foi avaliada com base na produção ou não de produto amplificado nas amostras de DNA. Dos onze locos testados, apenas dois apresentaram amplificação satisfatória (visualização do produto), perfazendo uma taxa de transferibilidade de 18%, sugerindo que as espécies possuam baixo grau de parentesco. Nos dois locos amplificados foi detectada também a presença de produtos secundários, o que pode gerar dificuldades na contagem de alelos por loco em gel de poliacrilamida. Esses resultados indicam baixa taxa de transferibilidade de locos de P. dactylifera para A. vulgare e, portanto, não devam ser indicados para acessar o genoma de A. vulgare.

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Main Authors: FORTES, A. C. R., OLIVEIRA, M. do S. P. de, OLIVEIRA, N. P. de, SILVA, I. C. da
Other Authors: ANDRÉA CRISTINA RODRIGUES FORTES, MESTRANDA UFRA; MARIA DO SOCORRO P DE OLIVEIRA, CPATU; NATÁLIA PADILHA DE OLIVEIRA, DOUTORANDA UFLA; ILENILCE CASTRO DA SILVA, MESTRANDA UFRA.
Format: Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2013-11-21
Subjects:Locos SSR, Tucumã,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/971864
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description Este trabalho foi realizado com o objetivo de testar a transferibilidade de locos SSR de Phoenix dactylifera para a espécie Astrocaryum vulgare. Para isso, foram aplicados onze locos desenvolvidos para P. dactylifera com variação de seis temperaturas de anelamento, em DNA de seis indivíduos adultos de A. vulgare. As reações de amplificação foram conduzidas de acordo com o protocolo desenvolvido com pequenas adaptações. Os produtos da amplificação foram aplicados em gel de agarose ultra pura a γ,η%, corado com brometo de etídio e submetido à eletroforese horizontal por duas horas. Em seguida, os géis foram fotodocumentados e as imagens armazenadas digitalmente. A transferibilidade dos locos foi avaliada com base na produção ou não de produto amplificado nas amostras de DNA. Dos onze locos testados, apenas dois apresentaram amplificação satisfatória (visualização do produto), perfazendo uma taxa de transferibilidade de 18%, sugerindo que as espécies possuam baixo grau de parentesco. Nos dois locos amplificados foi detectada também a presença de produtos secundários, o que pode gerar dificuldades na contagem de alelos por loco em gel de poliacrilamida. Esses resultados indicam baixa taxa de transferibilidade de locos de P. dactylifera para A. vulgare e, portanto, não devam ser indicados para acessar o genoma de A. vulgare.
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